r - 更新 R 中的包 : `update.packages` vs. `install.packages`

Question

我尝试加载 party 库并收到以下错误:

 Loading required package: zoo
 Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 
   namespace ‘lattice’ 0.20-24 is already loaded, but >= 0.20.27 is required
 Error: package ‘zoo’ could not be loaded

因此，我决定更新同一 session ( detach all packages while working in R ) 中的所有软件包，包括 lattice，希望 zoo 和 party一旦更新lattice，就会正确加载:

 pkgs <- names( sessionInfo()$otherPkgs )
 pkgs <- paste('package:', pkgs, sep = "")
 lapply( pkgs , detach, character.only = TRUE, unload = TRUE)
 update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE,
                 repos="http://r-forge.r-project.org",
                 oldPkgs=c("lattice","zoo","party")
 )

它不起作用(在同一 session 内并且在未预加载 .RData 的情况下重新启动后):

 > library(party)
 Loading required package: zoo
  Error in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]) : 
   namespace ‘lattice’ 0.20-24 is already loaded, but >= 0.20.27 is required
   Error: package ‘zoo’ could not be loaded

根据How to update R2jags in R?最好只在我想要更新的软件包上运行 install.packages，然后重新启动。确实，它成功了。

所以问题是:何时调用 update.packages ，因为至少可以说，运行 session 中的更新很脆弱，而 install.package 就可以了以重新启动 session 为代价的技巧？我缺少什么 R 包管理巫术？谢谢。

Answer 1

Dirk 提供了一个更通用的策略来避免这个问题。但是，如果您处于交互式 session 中，并且不想重新启动，并且想要卸载需要更新的软件包( detach(.) -ing 或 update.packages(.) -ing 都无法有效完成)，那么有一个函数，unloadNamespace这通常对我有用。它的帮助页面中有警告说它并不完全安全，但我没有遇到困难。尝试:

unloadNamespace("lattice")   # or lapply()-ing as you attempted with `detach`
update.packages("lattice")
require(lattice)  # or library()