macos - 使用ggplot2在R中保存pdf文件时出现问题

Question

我遇到了一个奇怪的问题。我可以使用 R/ggplot2 创建和保存 pdf 文件，并在 R 控制台运行时查看它们。一旦我退出 R 控制台，Mac OS X 上的预览将不再显示 PDF。我已经能够保存 .png 文件而没有问题，但由于我无法控制的原因，我需要保存为 pdf 文件。我用来保存的代码如下:

  pdfFile <-c("/Users/adam/mock/dir/structure.pdf")
  pdf(pdfFile)
  ggplot(y=count,data=allCombined, aes(x=sequenceName, fill=factor(subClass))) + geom_bar()
  ggsave(pdfFile)  

有人遇到过类似的问题吗？如果是这样，我需要做什么来修复它？非常感谢您抽出宝贵的时间。

Answer 1

问题是您没有使用 dev.off() 关闭 pdf() 设备

dat <- data.frame(A = 1:10, B = runif(10))
require(ggplot2)

pdf("ggplot1.pdf")
ggplot(dat, aes(x = A, y = B)) + geom_point()
dev.off()

这有效，如下:

ggplot(dat, aes(x = A, y = B)) + geom_point()
ggsave("ggplot1.pdf")

但不要将两者混为一谈。