r - Shiny 服务器中缺少软件包

Question

我正在尝试使用 Shiny 创建一个网络应用程序。它要求我加载我已安装在计算机上的软件包。例如:

## Contents ui.R:
library(shiny)
library(plyr)

shinyUI(pageWithSidebar(

  headerPanel("Hello Shiny!"),

  sidebarPanel(
    sliderInput("obs", 
                "Number of observations:", 
                min = 0, 
                max = 1000, 
                value = 500)
  ),

  mainPanel(
    plotOutput("distPlot")
  )
))

## Contents server.R:
library(shiny)
library(plyr)

shinyServer(function(input, output) {

  output$distPlot <- renderPlot({

    # generate an rnorm distribution and plot it
    dist <- rnorm(input$obs)
    hist(dist)
  })
})

如果我在本地运行它(使用runApp)，那么效果很好，但是当我尝试通过我的服务器(同一台计算机)运行它时，我收到错误，plyr软件包(或我尝试用这种方式使用的任何其他软件包)未安装。我如何在 Shiny 的服务器中使用额外的软件包？

Answer 1

问题是shiny-server无法找到您安装的软件包，因为它以称为shiny的不同用户身份运行它们。该用户是在安装shiny-server时创建的

解决此问题的最简单(也是最安全的)方法是使用以下步骤以 Shiny 用户身份安装软件包。

1. 使用sudo passwdshiny为用户设置密码，现在输入并确认密码
2. 使用以下命令切换到shiny帐户:su -shiny
3. 使用 $ R 调用 R(无需 sudo)
4. 安装所需的软件包，在本例中为:install.packages("plyr")

请注意，如果您在同一台计算机上安装了 rstudio-server，则可以使用该界面执行步骤 2-4。只需使用相同的域/IP 并使用 :8787 作为 rstudio-server 接口(interface)，而不是使用 :3838 作为 Shiny 服务器。

改编 self 的回答here .