r - 有没有使用随机投影进行降维的 R 实现？

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我有一个大 p (~20K) 和小 n (~500) 的问题。我首先想到的是降维。在尝试了 PCA、稳健的 PCA、ICA、删除高度相关的特征之后，我正在考虑使用随机投影。但是，随机投影没有简单的 R 实现。

我发现了一些随机投影 R 包，例如

1. MCLUST:https://cran.r-project.org/web/packages/mclust/index.html
2. RPEnsemble:https://cran.r-project.org/web/packages/RPEnsemble/index.html

但是，他们似乎不支持直接随机投影来降维。我对随机投影的了解有限，但我发现 sklearn 中的两个函数支持这一点:

高斯随机投影和稀疏随机投影: http://scikit-learn.org/stable/modules/random_projection.html

而且它的功能界面非常简单。

在 R 中可以轻松实现随机投影吗？或者，利用现有工具通过 R 中的随机投影进行降维？

Answer 1

我同意 RPEnsemble 包似乎没有公开允许您以任何方便的形式仅使用该功能的低级方法。

然而，我确实遇到了这个 R 源代码，它看起来相当简单并且记录合理:R source code for random projections 。这是 clusterv package 的一部分你可以在那里下载它。