perl - SignalP @INC 中的错误消息 : Can't locate FASTA. pm

Question

我在 Mac 上安装了 SignalP 4.0。我按照描述更改了文件夹目录和输出目录的路径。

然后，当我通过键入以下内容尝试测试脚本时:

   ./signalp -t euk -f summary test/euk10.fsa > euk10.fsa.summary_out

错误消息:

    Can't locate FASTA.pm in @INC (you may need to install the FASTA module)(@INC contains: ....) at ./signalp line 80.

在文件 signalp 第 80 行是:

 use FASTA;

我安装了 BioPerl，其中包含模块 Bio::BD::Fasta，我想这就是我所需要的。

但是，它仍然输出相同的错误消息。

Answer 1

你漏掉了“P”。尝试:$ENV{SIGNALP} = '/path/to/signalp/directory';