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r - 如何在 R 中的 PAM 中获取主成分数据

转载作者：行者123 更新时间：2023-12-02 23:12:45

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我使用 mtcars 数据使用 autoplot 函数创建一个图表，并得到这样的图表

这是我的代码:

library(cluster)
library(NbClust)
library(ggplot2)
library(ggfortify)
x <- mtcars
number.cluster <- NbClust(x, distance = "euclidean", min.nc = 1, max.nc = 5, method = "complete", index = "ch")
best.cluster <- as.numeric(number.cluster$Best.nc[1])
x.pam <- pam(x, best.cluster)
autoplot(x.pam, data = x, frame = T) + ggtitle("PAM MTCARS")

我的问题是如何根据该图获取 PC1 和 PC2 数据坐标？谢谢

最佳答案

您可以使用layer_data()来获取用于ggplot对象的数据:

p <- autoplot(x.pam, data = x, frame = T) + ggtitle("PAM MTCARS")
layer_data(p, 1L) # coordinates of all points
layer_data(p, 2L) # coordinates of points that contribute to polygons

关于r - 如何在 R 中的 PAM 中获取主成分数据，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/59207648/

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