distutils - 将F2PY编译步骤翻译成setup.py

Question

我继承了 Fortran 77 代码，该代码实现了多个子例程，这些子例程通过程序 block 运行，每次运行程序时都需要通过交互式命令提示符进行大量用户输入。由于我想自动运行代码，因此我将所有子例程移至一个模块中，并通过 F2PY 编写了包装器代码。两步编译后一切正常:

gfortran -c my_module.f90 -o my_module.o -ffixed-form
f2py -c my_module.o -m my_wrapper my_wrapper.f90

这最终会创建三个文件:my_module.o、my_wrapper.o、my_module.mod 和 my_wrapper.so。 my_wrapper.so 是我导入到 Python 中以访问旧版 Fortran 代码的模块。

我的目标是将此代码包含在更大的科学代码包中使用，该代码包已经有一个使用 distutils 构建 Cython 模块的 setup.py 。暂时完全忽略 Cython 代码，我应该如何将两步构建转换为 setup.py 中的扩展？我已经能够弄清楚的关闭看起来像:

from numpy.distutils.core import setup, Extension
wrapper = Extension('my_wrapper', ['my_wrapper.f90', ])
setup(
    libraries = [('my_module', dict(sources=['my_module.f90']],
                                    extra_f90_compile_args=["-ffixed-form", ])))],
    ext_modules = [wrapper, ]
)

但这不起作用。我的编译器在 my_module.f90 上抛出许多警告，但它仍然可以编译(如果我使用上面的编译器调用，它不会抛出任何警告)。当它尝试编译包装器时，即使已成功创建，也无法找到 my_module.mod。

有什么想法吗？我有一种感觉，我错过了一些微不足道的东西，但文档似乎不够充实，不足以表明它可能是什么。

Answer 1

可能有点晚了，但你的问题是你没有链接到 my_module构建时my_wrapper :

wrapper = Extension('my_wrapper', sources=['my_wrapper.f90'], libraries=['my_module'])

setup(
    libraries = [('my_module', dict(sources=['my_module.f90'],
                                    extra_f90_compile_args=["-ffixed-form"]))],
    ext_modules = [wrapper]
)

如果您只使用my_module用于my_wrapper ，您只需将其添加到 my_wrapper 的源中即可:

wrapper = Extension('my_wrapper', sources=['my_wrapper.f90', 'my_module.f90'],
                                  extra_f90_compile_args=["-ffixed-form"])
setup(
    ext_modules = [wrapper]
)

请注意，这还将导出 my_module 中的所有内容到 Python，您可能不想要它。

我正在Python之外处理这样一个两层库结构，使用cmake作为顶层构建系统。我已将其设置为 make python调用 distutils 来构建 Python 包装器。 setup.py我们可以放心地假设所有外部库都已构建并安装。如果希望拥有在系统范围内安装的通用库，然后为不同的应用程序(例如Python)进行包装，那么这种策略是有利的。 , Matlab , Octave , IDL ，...，它们都有不同的方式来构建扩展。