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带有 .pdb 文件的 python

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 22:14:31 24 4
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我正在做生物项目。
我有 .pdb(蛋白质数据库)文件,其中包含有关分子的信息。

我想找出 .pdb 文件中分子的以下内容:

  1. 分子质量。
  2. H 键供体。
  3. H 键受体。
  4. LogP。
  5. 折射率。

在找到这个时,python中有没有可以处理.pdb文件的模块?
如果没有,那么有人可以让我知道我该怎么做吗?

我找到了一些模块,比如 sequtilsprotienparam 但它们不做这样的事情。
我是先研究后发帖的,所以请不要投反对票。
如果您仍然不赞成这样做的原因,请发表评论。

提前致谢。

最佳答案

我不知道它是否符合您的需求,但是Biopython看起来可能会有帮助。

关于带有 .pdb 文件的 python,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/14723707/

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