r - 翻转树状图

Question

我正在使用 ggdendrogram 绘制树状图，但我想在左侧添加标签以使图形更直观。我该怎么做呢？谢谢!!!

library(ggplot2)
library(ggdendro)

### Data
countries <- c("UK","AU","SA","CH")
distmatrix <- matrix(c(0.00, 0.16, 1.01, 0.97, 0.16, 0.00, 0.84, 0.79, 1.01, 0.84, 0.00, 1.49, 0.97, 0.79, 1.49, 0.00),
nrow=4,dimnames=list(countries, countries))

### Cluster
hc = hclust(as.dist(distmatrix), method = "ward")

### Plot
ggdendrogram(hc, rotate=TRUE, theme_dendro=FALSE)

Answer 1

重点是当 rotate=TRUE 时代码 ggdendrogram 这样做:

if (rotate) {
    p <- p + coord_flip()
    p <- p + scale_y_reverse(expand = c(0.2, 0))
}

但是您不希望完成 scale_y_reverse(.)。因此，一种方法是您自己执行 coord_flip()。

ggdendrogram(hc, rotate=FALSE, theme_dendro=FALSE) + coord_flip()

但是，一个明显的问题是 labels 无法正确对齐。你不能在 ggdendrogram() 函数中做很多事情，因为它不允许在外部设置 hjust 和 angle 属性。

因此，对于您的情况，我建议您通过复制 ggdendrogram 函数中的行来自己创建 ggplot()。

data <- dendro_data(hc)
p <- ggplot() + geom_segment(data = segment(data), 
              aes_string(x = "x", y = "y", xend = "xend", yend = "yend"))
p <- p + geom_text(data = label(data), 
              aes_string(x = "x", y = "y", label = "label"), hjust = 1, angle = 0)
p + scale_y_continuous(expand=c(0.2, 0)) + coord_flip()

这给出:

另一种方法是根据您的需要修改 ggdendrogram 函数并重新编译它。我认为这样做更容易，而且也正是您想要的: