- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我想按Hadoop中的列计算均值和标准差。
我简单地对MapReduce采用单次通过朴素算法。
我在多变量数据集455000x90和650000x120上进行了测试,并获得了更低,更多,然后处理器数量更多的加速。对于具有2个 Activity 内核的独立和伪分布式模式,对于455000x90,我的加速比为0.4 = 20秒/ 53秒。
为什么我的程序无效?有可能改善它吗?
映射器:
public class CalculateMeanAndSTDEVMapper extends
Mapper <LongWritable,
DoubleArrayWritable,
IntWritable,
DoubleArrayWritable> {
private int dataDimFrom;
private int dataDimTo;
private long samplesCount;
private int universeSize;
@Override
protected void setup(Context context) throws IOException {
Configuration conf = context.getConfiguration();
dataDimFrom = conf.getInt("dataDimFrom", 0);
dataDimTo = conf.getInt("dataDimTo", 0);
samplesCount = conf.getLong("samplesCount", 0);
universeSize = dataDimTo - dataDimFrom + 1;
}
@Override
public void map(
LongWritable key,
DoubleArrayWritable array,
Context context) throws IOException, InterruptedException {
DoubleWritable[] outArray = new DoubleWritable[universeSize*2];
for (int c = 0; c < universeSize; c++) {
outArray[c] = new DoubleWritable(
array.get(c+dataDimFrom).get() / samplesCount);
}
for (int c = universeSize; c < universeSize*2; c++) {
double val = array.get(c-universeSize+dataDimFrom).get();
outArray[c] = new DoubleWritable((val*val) / samplesCount);
}
context.write(new IntWritable(1), new DoubleArrayWritable(outArray));
}
}
public class CalculateMeanAndSTDEVCombiner extends
Reducer <IntWritable,
DoubleArrayWritable,
IntWritable,
DoubleArrayWritable> {
private int dataDimFrom;
private int dataDimTo;
private int universeSize;
@Override
protected void setup(Context context) throws IOException {
Configuration conf = context.getConfiguration();
dataDimFrom = conf.getInt("dataDimFrom", 0);
dataDimTo = conf.getInt("dataDimTo", 0);
universeSize = dataDimTo - dataDimFrom + 1;
}
@Override
public void reduce(
IntWritable column,
Iterable<DoubleArrayWritable> partialSums,
Context context) throws IOException, InterruptedException {
DoubleWritable[] outArray = new DoubleWritable[universeSize*2];
boolean isFirst = true;
for (DoubleArrayWritable partialSum : partialSums) {
for (int i = 0; i < universeSize*2; i++) {
if (!isFirst) {
outArray[i].set(outArray[i].get()
+ partialSum.get(i).get());
} else {
outArray[i]
= new DoubleWritable(partialSum.get(i).get());
}
}
isFirst = false;
}
context.write(column, new DoubleArrayWritable(outArray));
}
}
public class CalculateMeanAndSTDEVReducer extends
Reducer <IntWritable,
DoubleArrayWritable,
IntWritable,
DoubleArrayWritable> {
private int dataDimFrom;
private int dataDimTo;
private int universeSize;
@Override
protected void setup(Context context) throws IOException {
Configuration conf = context.getConfiguration();
dataDimFrom = conf.getInt("dataDimFrom", 0);
dataDimTo = conf.getInt("dataDimTo", 0);
universeSize = dataDimTo - dataDimFrom + 1;
}
@Override
public void reduce(
IntWritable column,
Iterable<DoubleArrayWritable> partialSums,
Context context) throws IOException, InterruptedException {
DoubleWritable[] outArray = new DoubleWritable[universeSize*2];
boolean isFirst = true;
for (DoubleArrayWritable partialSum : partialSums) {
for (int i = 0; i < universeSize; i++) {
if (!isFirst) {
outArray[i].set(outArray[i].get() + partialSum.get(i).get());
} else {
outArray[i] = new DoubleWritable(partialSum.get(i).get());
}
}
isFirst = false;
}
for (int i = universeSize; i < universeSize * 2; i++) {
double mean = outArray[i-universeSize].get();
outArray[i].set(Math.sqrt(outArray[i].get() - mean*mean));
}
context.write(column, new DoubleArrayWritable(outArray));
}
}
public class DoubleArrayWritable extends ArrayWritable {
public DoubleArrayWritable() {
super(DoubleWritable.class);
}
public DoubleArrayWritable(DoubleWritable[] values) {
super(DoubleWritable.class, values);
}
public DoubleWritable get(int idx) {
return (DoubleWritable) get()[idx];
}
}
最佳答案
我问了有关在相同环境中有相同问题的另一项工作的问题。大卫·格鲁兹曼(David Gruzman)猜测在差异作业开始时间(本地,群集)中存在该问题。他建议使用最佳数据大小,以在这种环境下获得良好的加速(5 GB)。我尝试过,这是真的。
Why job with mappers only is so slow in real cluster?
关于statistics - 通过Hadoop中的列计算均值和标准差,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/8029527/
我正在 csv 上使用 hadoop 来分析一些数据。我使用sql/mysql(不确定)来分析数据,现在陷入了僵局。 我花了好几个小时在谷歌上搜索,却没有找到任何相关的东西。我需要一个查询,在该查询中
我正在为 Bootstrap 网格布局的“简单”任务而苦苦挣扎。我希望在大视口(viewport)上有 4 列,然后在中型设备上有 2 列,最后在较小的设备上只有 1 列。 当我测试我的代码片段时,似
对于这个令人困惑的标题,我深表歉意,我想不出这个问题的正确措辞。相反,我只会给你背景信息和目标: 这是在一个表中,一个人可能有也可能没有多行数据,这些行可能包含相同的 activity_id 值,也可
具有 3 列的数据库表 - A int , B int , C int 我的问题是: 如何使用 Sequelize 结果找到 A > B + C const countTasks = await Ta
我在通过以下功能编写此查询时遇到问题: 首先按第 2 列 DESC 排序,然后从“不同的第 1 列”中选择 只有 Column1 是 DISTINCT 此查询没有帮助,因为它首先从第 1 列中进行选择
使用 Bootstrap 非常有趣和有帮助,目前我在创建以下需求时遇到问题。 “使用 bootstrap 在桌面上有 4 列,在平板电脑上有 2 列,在移动设备上有 1 列”谁能告诉我正确的结构 最佳
我是 R 新手,正在问一个非常基本的问题。当然,我在尝试从所提供的示例中获取指导的同时做了功课here和 here ,但无法在我的案例中实现这个想法,即可能是由于我的问题中的比较维度更大。 我的实
通常我会使用 R 并执行 merge.by,但这个文件似乎太大了,部门中的任何一台计算机都无法处理它! (任何从事遗传学工作的人的附加信息)本质上,插补似乎删除了 snp ID 的 rs 数字,我只剩
我有一个 df , delta1 delta2 0 -1 2 0 -1 0 0 0 我想知道如何分配 delt
您好,我想知道是否可以执行以下操作。显然,我已经尝试在 phpMyAdmin 中运行它,但出现错误。也许还有另一种方式来编写此查询。 SELECT * FROM eat_eat_restaurants
我有 2 个列表(标题和数据值)。我想要将数据值列 1 匹配并替换为头文件列 1,以获得与 dataValue 列 1 和标题值列 2 匹配的值 头文件 TotalLoad,M0001001 Hois
我有两个不同长度的文件,file2 是一个很大的引用文件,我从中提取文件 1 的数据。 我有一行 awk,我通常会对其进行调整以在我的文件中进行查找和替换,但它总是在同一列中进行查找和替换。 所以对于
假设我有两个表,如下所示。 create table contract( c_ID number(1) primary key, c_name varchar2(50) not
我有一个带有 varchar 列的 H2 表,其检查约束定义如下: CONSTRAINT my_constraint CHECK (varchar_field <> '') 以下插入语句失败,但当我删
这是最少量的代码,可以清楚地说明我的问题: One Two Three 前 2 个 div 应该是 2 个左列。第三个应该占据页面的其余部分。最后,我将添加选项来隐藏和
在 Azure 中的 Log Analytics 中,我为 VM Heartbeat 选择一个预定义查询,我在编辑器中运行查询正常,但当我去创建警报时,我不断收到警报“查询未返回 TimeGenera
在 Azure 中的 Log Analytics 中,我为 VM Heartbeat 选择一个预定义查询,我在编辑器中运行查询正常,但当我去创建警报时,我不断收到警报“查询未返回 TimeGenera
今天我开始使用 JexcelApi 并遇到了这个:当您尝试从特定位置获取元素时,不是像您通常期望的那样使用sheet.getCell(row,col),而是使用sheet.getCell(col,ro
我有一个包含 28 列的数据库。第一列是代码,第二列是名称,其余是值。 public void displayData() { con.Open(); MySqlDataAdapter
我很沮丧:每当我缩小这个网页时,一切都变得一团糟。我如何将网页居中,以便我可以缩小并且元素不会被错误定位。 (它应该是 2 列,但所有内容都合并为 1)我试过 但由于某种原因,这不起作用。 www.o
我是一名优秀的程序员,十分优秀!