r - 从.Xdf文件中删除重复的记录

Question

我想从我的大型.xdf文件trans.xdf中删除重复的记录。
这是文件详细信息:

File name: /poc/revor/data/trans.xdf
Number of observations: 1000000000
Number of variables: 5
Number of blocks: 40
Compression type: zlib
Variable information:
Var 1: CARD_ID, Type: character
Var 2: SE_NO, Type: character
Var 3: r12m_cv, Type: numeric, Low/High: (-2348.7600, 40587.3900)
Var 4: r12m_roc, Type: numeric, Low/High: (0.0000, 231.0000)
Var 5: PROD_GRP_CD, Type: character

下面也是该文件的示例数据:

CARD_ID SE_NO   r12m_cv r12m_roc    PROD_GRP_CD
900000999000000000          1045815024  110 1   1
900000999000000000          1052487253  247.52  2   1
900000999000000000          9999999999  38.72   1   1
900000999000000000          1090389768  1679.96 16  1
900000999000000000          1091226035  0   1   1
900000999000000000          1091241208  538.68  4   1
900000999000000000          9999999999  83  1   1
900000999000000000          1091468041  148.4   3   1
900000999000000000          1092640358  3.13    1   1
900000999000000000          1093468692  546.29  1   1

我尝试使用rxDataStep函数来使用它的transform参数在.xdf文件上调用unique()函数。下面是相同的代码:

uniq_dat <- function( dataList )
{
    datalist <- unique(datalist)
    return(datalist)
}

rxDataStepXdf(inFile = "/poc/revor/data/trans.xdf",outFile = "/poc/revor/data/trans.xdf",transformFunc = uniq_dat,overwrite = TRUE) 

但是出现以下错误:

Error in unique(datalist) : object 'datalist' not found

Error in transformation function: Error in unique(datalist) : object 'datalist' not found

Error in rxCall("RxDataStep", params) :

因此，任何人都可以指出我在这里所做的错误，或者是否有更好的方法从.Xdf文件中删除重复的记录。我避免将数据加载到内存数据帧中，因为数据非常大。

我正在通过HDFS在Revolution R Environment中运行以上代码。

如果可以通过任何其他方法获得相同的内容，则可以理解相同的示例。

我在这里先向您的帮助表示感谢 :)

干杯，

阿米特

Answer 1

您可以通过为rxSort()函数提供removeDupKeys = TRUE参数来删除重复值。例如，您的情况:

XdfFilePath <- file.path("<your file's fully qualified path>/trans.xdf")
rxSort(inData = XdfFilePath,sortByVars=c("CARD_ID","SE_NO","r12m_cv","r12m_roc","PROD_GRP_CD"), removeDupKeys=TRUE) 

如果要基于特定键列(例如，基于SE_NO列)删除重复记录
将键值设置为sortByVars =“SE_NO”