r - 自动响应 “Yes”对R库的提示

Question

我正在努力定义一个Docker容器，该容器可以在云环境中启动，并在我们公司的数据库上运行一些报告，然后自行分解，而无需数据科学团队(包括我自己)的参与。

我几乎完成了所有工作的启动和运行，但有一个令人烦恼的异常(exception)-报告是使用我们使用了几年的一些代码在R中完成的。我在Rocker诗句的基础上构建，并添加了需求库。

关于需求的烦人的事情(在此用例中)是，当它第一次运行时，它会询问以下内容:

>library('needs')

Should `needs` load itself when it's... needed?   (this is recommended)

1: No
2: Yes

Selection:

在典型的交互式设置中，这很好，我只需键入"is"，然后按Enter键就可以了。但是，当我希望整个环境每周独立构建和运行一次时，我不想回答这个问题。我想假设是。

到目前为止，我尝试过的内容包括:

library('needs', quiet=TRUE)
library('needs', quietly=TRUE)
suppressMessages(library('needs', quietly=TRUE))
suppressWarnings(suppressMessages(library('needs', quietly = T)))
suppressPackageStartupMessages(library('needs', quietly=TRUE))

没有一个能解决问题。 needs documentation允许以后以编程方式更改此设置，但不能在首次运行需要时定义该设置:

Recommended use is to allow the function to autoload when prompted the first time the package is loaded interactively. To change this setting later, run needs:::autoload(TRUE) or needs:::autoload(FALSE) to turn autoloading on or off, respectively.

我也尝试过安静地安装需求，但无济于事。不幸的是，我无法在Dockerfile中运行bash命令来响应"is"，或者至少我没有找到方法。

我想避免删除需求的依赖关系，因为这将涉及大量代码重构。

关于如何解决这个问题的任何想法？

谢谢! :]
-文斯

更新

解决方案有点笨拙，但是在我的Dockerfile中，我正在对该文件进行vim编辑，该文件需要分配给sysfile变量:

sysfile <- system.file("extdata", "promptUser", package = "needs")

对于我来说，它是/ usr / local / lib / R / site-library / needs / extdata / promptUser，然后将其内容从“1”更改为“0”来解决我的问题。

Answer 1

更好的解决方案可能是这样做，这样它就不会首先提出问题。您可以查看它在github上的包加载时运行的代码:https://github.com/cran/needs/blob/master/R/needs-package.R

如果您设置了该选项，则它会事先进行检查，因此不需要首先提出以下问题:

options(needs.promptUser = FALSE)