r - dunn 的循环数据帧列的测试

Question

我正在尝试对 Iris 数据执行 Dunn 检验。我想循环 4 列，并对不同物种的每列执行 Dunn 测试。但是，当我尝试获取列名称时，它不起作用。谁能告诉我为什么？

library(rstatix)
data<-iris
for (i in seq(1:4)) {
  a<-colnames(data)
  colname1 <-as.character(a[5])
  colname2 <-as.character(a[i])
  dtest<-data %>% 
   dunn_test( get(colname2) ~ get(colname1), p.adjust.method = "BH") 
  print(dtest)
  print(i)
}

Answer 1

您可以使用 lapply 迭代列名称，并使用 reformulate 创建公式对象。使用 iris 数据集，您可以执行以下操作:

colname1 <- names(iris)[5]
colname2 <- names(iris)[1:4]

data <- lapply(colname2, function(x) {
           rstatix::dunn_test(iris, reformulate(colname1, x),  
                              p.adjust.method = "BH")
         })
data
#[[1]]
# A tibble: 3 x 9
#  .y.          group1     group2        n1    n2 statistic        p    p.adj p.adj.signif
#* <chr>        <chr>      <chr>      <int> <int>     <dbl>    <dbl>    <dbl> <chr>       
#1 Sepal.Length setosa     versicolor    50    50      6.11 1.02e- 9 1.53e- 9 ****        
#2 Sepal.Length setosa     virginica     50    50      9.74 2.00e-22 6.00e-22 ****        
#3 Sepal.Length versicolor virginica     50    50      3.64 2.77e- 4 2.77e- 4 ***         

#[[2]]
# A tibble: 3 x 9
#  .y.         group1     group2        n1    n2 statistic        p    p.adj p.adj.signif
#* <chr>       <chr>      <chr>      <int> <int>     <dbl>    <dbl>    <dbl> <chr>       
#1 Sepal.Width setosa     versicolor    50    50     -7.79 6.82e-15 2.05e-14 ****        
#2 Sepal.Width setosa     virginica     50    50     -5.37 7.68e- 8 1.15e- 7 ****        
#3 Sepal.Width versicolor virginica     50    50      2.41 1.58e- 2 1.58e- 2 * 
#...
#...