docker - docker与已激活的conda环境进行交互运行

Question

我想创建一个docker镜像，以便在以交互方式运行它时，已经激活了conda环境。
当前状态:

docker run -it my_image
(base) root@1c32ba066db2:~# conda activate my_env
(my_env) root@1c32ba066db2:~#

所需状态:

docker run -it my_image
(my_env) root@1c32ba066db2:~#

更多信息:
在我的Dockerfile中，我包括了所有必要的 RUN命令，以安装conda，创建环境和激活环境。相关部分转载于下。

SHELL [ "/bin/bash", "--login", "-c" ]

...

# Install miniconda.
ENV CONDA_DIR $HOME/miniconda3
RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \
    chmod +x ~/miniconda.sh && \
    ~/miniconda.sh -b -p $CONDA_DIR && \
    rm ~/miniconda.sh
# Make non-activate conda commands available.
ENV PATH=$CONDA_DIR/bin:$PATH
# Make conda activate command available from /bin/bash --login shells.
RUN echo ". $CONDA_DIR/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.profile
# Make conda activate command available from /bin/bash --interative shells.
RUN conda init bash

# Create and activate the environment.
RUN conda env create --force -f environment.yml
RUN conda activate my_env

当我运行此命令时， conda activate my_env似乎可以运行并成功。但是，当我使用 docker run -it交互输入时，激活的env是 (base)。
另外，我尝试使最后一个命令为 CMD conda activate my_env，但是它仅运行该命令，并且不进入交互模式。

Answer 1

每个RUN语句(包括docker run)都在新的shell中执行，因此不能简单地在RUN命令中激活环境并期望它在后续的RUN命令中继续处于 Activity 状态。
相反，您需要在 shell 初始化中激活环境。 SHELL命令已被更改为包括--login，这很棒。现在，您只需要将conda activate my_env添加到.profile或.bashrc中:

...
# Create and activate the environment.
RUN conda env create --force -f environment.yml
RUN echo "conda activate my_env" >> ~/.profile

并确保这是在Conda添加的部分之后。