仅在使用 RStudio 时出现 rJava 包加载错误(可能是 LD_LIBRARY_PATH 问题)

Question

我遇到了与此 question 中讨论的相同错误消息，归结为:

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/home/anh/Rlibs/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory

问题是按照那里的答案(即设置LD_LIBRARY_PATH指向libjvm.so)解决了我在命令行R中的问题>，但 Rstudio 仍然找不到 libjvm.so。

系统规范:Ubuntu 14.04、R 3.1.1、Rstudio Desktop 0.98、apt-get install r-cran-rjava 已完成

Answer 1

感谢@hrbrmstr的评论，我在RStudio支持论坛中搜索了LD_LIBRARY_PATH并找到了这个解决方案。

问题确实归结为 Rstudio 无法找到 libjvm.so。我在/etc/environment中设置了LD_LIBRARY_PATH，因此可以通过终端R加载library(rjava)。但是，Rstudio不会查看etc/environment，因此不知道LD_LIBRARY_PATH。

结果:在~/.profile中设置LD_LIBRARY_PATH，使其可用于所有桌面应用程序(如Ubuntu wiki article on persistent environment variable建议)

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-7-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre/lib/amd64/server

然后

sudo R CMD javareconf