r - 如何使用JDBC/Hive构建一个运行Shiny应用程序的Dockerfile(需要rJava)？

Question

我需要一个Dockerfile来运行 Shiny 的应用程序，该应用程序能够使用JDBC连接到Hive 。软件包RJDBC取决于软件包rJava，因此也取决于Java。现在，我测试了多个选项:

以具有Java的摇摆器/反向和手动添加Shiny 。

使用 rocker / shiny 和手动添加Java 。

两种选择都部分起作用，但不能完全起作用。 Hive连接的R代码如下:

require(RJDBC)
urlJDBC = "jdbc:hive2://...:8443/;ssl=true;sslTrustStore=./cacerts;trustStorePassword=changeit?hive.server2.transport.mode=http;hive.server2.thrift.http.path=gateway/default/hive"
driver = JDBC("org.apache.hive.jdbc.HiveDriver", "hive-jdbc-standalone.jar", identifier.quote="`")
con = dbConnect(driver, urlJDBC, "username", "password")

我还在Dockerfile中添加了JDBC Jar文件，其内容如下:

ADD ... ./hive-jdbc-standalone.jar

但是，我无法成功运行它。
有人有可以与Shiny和Hive / JDBC一起使用的blueproint DOCKERFILE吗？会很好

中号

Answer 1

经过错误方向几个小时的解决。

问题出在版权管理上。 缺少对JAR文件的读取访问权限。

新的DOCKERFILE非常简单:

FROM rocker/shiny

# Download and rename JAR file with JDBC HIVE driver.
WORKDIR /srv/shiny-server/apps/shinyhive
ADD <..jar-on-local-server..> ./hive-jdbc-standalone.jar

RUN apt-get update && apt-get install -y \
    openjdk-8-jdk liblzma-dev libbz2-dev libicu-dev libssl-dev \
    && R CMD javareconf

RUN R -e "install.packages('RJDBC', repos='http://cran.r-project.org')"

RUN chmod 777 -R .
COPY . .
COPY ./shiny-server.sh /usr/bin/shiny-server.sh

EXPOSE 3838

CMD ["/usr/bin/shiny-server.sh"]