python - Python中的替换功能不起作用(其他答案没有解决我的问题)

Question

我知道这是一个重复的问题，但我尝试了其他问题的答案，但无法解决该问题。

总之，我想用“A A”替换 0，用“A B”替换 1，用“B B”替换 2，用“0 0”替换 5。

我的估算数据文件 (datafile.txt) 格式如下所示，我想仅替换“Geno”列中的信息(在真实数据集中，我有一百万行)。

<表类=“s-表”><标题>示例基因 <正文>ID111010111151ID212000120022ID312055520022ID412000120022

我使用的管道是:

import pandas as pd
#input file
fin = pd.read_table('dataframe.txt',sep = ' ', header=None)
df = pd.DataFrame(fin)
geno = (df.iloc[: , 1:])
id = (df.iloc[: , 0])
geno = pd.DataFrame(geno)
geno2 = geno.replace("0","A A ").replace("1","A B ").replace("2","B B ").replace("5","0 0 ")

感谢您的帮助!我是在 bash 中(使用 awk)执行此操作，但需要很长时间。我决定尝试使用 Python，因为我相信会更快。 PS:我是Python初学者。再次感谢您。

Answer 1

尝试:

df.Geno = df.Geno.astype(str).str.replace("0","A A ").str.replace("1","A B ").str.replace("2","B B ").str.replace("5","0 0 ")

输出:

  Sample                                          Geno
0    ID1  A B A B A A A B A A A B A B A B A B 0 0 A B 
1    ID2  A B B B A A A A A A A B B B A A A A B B B B 
2    ID3  A B B B A A 0 0 0 0 0 0 B B A A A A B B B B 
3    ID4  A B B B A A A A A A A B B B A A A A B B B B