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r - 无法分配 geom_raster 大小向量的问题

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 18:43:43 25 4
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我对geom_raster函数中反复出现的大小向量无法分配问题感到惊讶。这个问题发生在小数据集上,在我的例子中,有 1559 个观察值。我尝试这样做:

# Read the raster in data frame format
ras_df<-read.csv("https://raw.githubusercontent.com/Leprechault/trash/main/myraster_df.csv")
str(ras_df)
#'data.frame': 1559 obs. of 3 variables:
# $ cc : num 65 85.6 82.7 85.6 89.4 ...
# $ longitude: num -50.6 -50.6 -50.6 -50.6 -50.6 ...
# $ latitude : num -24.2 -24.2 -24.2 -24.2 -24.2 ...

# Representation
ggplot() +
geom_raster(data = ras_df , aes(x = longitude, y = latitude, fill = cc)) +
scale_fill_gradientn(name="Canopy cover",colours = rev(terrain.colors(100)))+
xlab("longitude") + ylab("latitude") +
theme_bw() +
coord_quickmap() +
theme(panel.border = element_blank(), panel.grid.major = element_blank(),
panel.grid.minor = element_blank(), axis.line = element_line(colour = "black"),
text=element_text(size=16, family="serif"),legend.position="bottom")
#
#
#Error: 20254.0 Gb size vector cannot be allocated

但是如果我使用普通的 plot() 函数,这种情况就不会发生,但我会寻找更漂亮的表示形式,例如 ggplot2 输出。一些包含某些解决方案的帖子对我来说效果不太好(例如,SpatialPixelsDataFrame 转换和容差控制)。

请问,我有什么解决办法吗?

最佳答案

错误附带的警告提供了信息

In addition: Warning messages:
1: Raster pixels are placed at uneven horizontal intervals and will be shifted. Consider using geom_tile() instead.
2: Raster pixels are placed at uneven vertical intervals and will be shifted. Consider using geom_tile() instead.

当数据具有虚假精度时,就会发生这种情况,因此 geom_raster 尝试创建一个非常精细的网格,但会使用大量内存。

解决方案是将数据四舍五入到适当的精度。

library(tidyverse)
ras_df <- ras_df %>% mutate(across(c(latitude, longitude), round, digits = 4))

然后情节就可以正常工作了。

关于r - 无法分配 geom_raster 大小向量的问题,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/67724203/

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