r - 大稀疏矩阵到三角矩阵 R

Question

我在 R 中有一个非常大的(大约 9100 万个非零条目)sparseMatrix() 看起来像:

> myMatrix 
  a b c  
a . 1 2
b 1 . .
c 2 . .

我想将它转换为三角矩阵(上或下)，但是当我尝试 myMatrix = myMatrix * lower.tri(myMatrix) 时出现错误，即“问题太大” for lower.tri( ).想知道是否有人知道解决方案。谢谢你的帮助!

Answer 1

与其处理矩阵本身，不如处理它的summary:

library(Matrix)
myMatrix <- sparseMatrix(
    i = c(1,1,2,3),
    j = c(2,3,1,1),
    x = c(1,2,1,2))

myMatrix
# 3 x 3 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#           
# [1,] . 1 2
# [2,] 1 . .
# [3,] 2 . .

mat.summ   <- summary(myMatrix)
lower.summ <- subset(mat.summ, i >= j)

sparseMatrix(i = lower.summ$i,
             j = lower.summ$j,
             x = lower.summ$x,
             dims = dim(myMatrix))
# 3 x 3 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
#           
# [1,] . . .
# [2,] 1 . .
# [3,] 2 . .