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pandas - Seaborn clustermap 不显示行颜色

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 17:17:42 24 4
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我使用 seaborn.clustermap 生成了一个 clustermap。我想显示 row_colors 选项来突出显示一些集群,但这是我得到的结果:

clustermap with missing row_colors

在这里你可以找到我的代码:

pal = sns.light_palette('red', np.unique(labels).size)
lut = dict(zip(np.unique(labels), pal))
row_colors = pd.Series(labels, name='clusters').map(lut)
sns.clustermap(my_data, method='ward', robust=True, row_colors=row_colors)

但是,如果我运行 seaborn 文档中的示例,我没有任何问题:

enter image description here

iris = sns.load_dataset("iris")
species = iris.pop("species")
lut = dict(zip(species.unique(), "rbg"))
row_colors = species.map(lut)
g = sns.clustermap(iris, row_colors=row_colors)

为什么突出显示在我的代码中不起作用?

最佳答案

非常感谢您回答错误。我发现了问题。我有一个 MultiIndex 数据框,由于某种原因它没有绘制 row_color。实际上这是与 iris 示例代码的唯一区别。

我刚刚解决了这个问题:

sns.clustermap(my_data.reset_index(drop=True), method='ward', robust=True, row_colors=row_colors)

现在可以了:

enter image description here

我不知道这是否可以被视为一个错误,但它看起来像。也许这有助于修复它。

关于pandas - Seaborn clustermap 不显示行颜色,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/45322463/

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