grails - Groovy CSV解析器并导出到数据库

Question

如何在不解析第一行的情况下解析CSV文件？

该类工作正常，但我不想解析CSV的 header 。

import groovy.sql.Sql

class CSVParserService {

    boolean transactional = false

    def sql = Sql.newInstance("jdbc:mysql://localhost/RProject", "xxx", "xxx", "com.mysql.jdbc.Driver")

    def CSVList = sql.dataSet("ModuleSet")

    def CSVParser(String filepath, boolean header) {

      def parse = new File(filepath)

      // split and populate GeneInfo
      parse.splitEachLine(',') {fields ->

        CSVList.add(
                Module : fields[0],
                Function : fields[1],
                Systematic_Name : fields[2],
                Common_Name : fields[3],
              )

         return CSVList
      }

    }
}

我更改了类(class)，所以现在有了:

import groovy.sql.Sql

class CSVParserService {

    boolean transactional = false

    def sql = Sql.newInstance("jdbc:mysql://localhost/RProject", "xxx", "xxx", "com.mysql.jdbc.Driver")

    def CSVList = sql.dataSet("ModuleSet")

    def CSVParser(String filepath, boolean header) {

    def parse = new File(filepath).readLines()[1..-1]

    parse.each {line ->

      // split and populate GeneInfo
      line.splitEachLine(',') {fields ->

        CSVList.add(
                Module : fields[0],
                Function : fields[1],
                Systematic_Name : fields[2],
                Common_Name : fields[3],
              )

         return CSVList
      }
     }
    }
}

正常工作，直到我的CSV中的这一部分:
“智人白介素4受体(IL4R)，转录变体1，mRNA。”

当我的解析器得到此部分时，他切入3(应为1):
-智人白细胞介素4受体(IL4R)
-笔录变体1
-mRNA。

我该如何解决？
谢谢您的帮助。

-新评论-
这是我的CSV行的副本(第二行):
“M6.6”，NA，“ILMN_1652185”，NA，NA，“IL4RA; CD124”，NA，“NM_000418.2”，“16”，“16p12.1a”，“智人白细胞介素4受体(IL4R)，转录变体1，mRNA。“，3566，...

如您所见，我的问题在于“智人白细胞介素4受体(IL4R)，转录变体1，mRNA”。 ;我不想在“和”之间剪切文本。我的解析器应该只在引号之间分割'，'(但不要在引号之间使用逗号)。
例如，我有:“part1”，“part2”，“part3”，我只想剪切part1，part2，part3，如果我的part2中有逗号，则我不想剪切这些逗号。

总结起来，我只想忽略引号中的逗号。

Answer 1

您可以使用以下命令将文件的第一行以外的每一行读入List中:

List<String> allLinesExceptHeader = new File(filepath).readLines()[1..-1]

然后，可以使用类似于上面显示的代码来解析文件的每一行( allLinesExceptHeader的元素)

allLinesExceptHeader.each {line ->    
    // Code to parse each line goes here
}