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我想绘制一系列独立伯努利分布随机变量 y 的对数似然函数,参数 p 是某个特征 x 的函数(逻辑函数)。该逻辑函数还有一个参数 b。这是我要估计的参数。所以我想将对数似然绘制为 b 的函数。我想在 R 中使用 ggplot2 来做到这一点,因为我想在这些方面变得更好。
我对对数似然函数的创建可以而且应该做得更好,但这不是我的观点。问题是绘制的对数似然在区间 (-5,5) 内是恒定的。这似乎是错误的。特别是,因为当我在该区间内使用任意 b 调用该函数时,它会返回不同的值。为什么会出现这种情况?谢谢。
library(ggplot2)
set.seed(123)
# parameters
n=100
mu=0
s=2
b<-0.2
# functions
logit <- function(x,b){1/(1+exp(-b*x))}
# simulation of data
x<-rnorm(n,mu,s)
y_prob<-logit(x,b)
y<-rbinom(n,1,y_prob)
df<-data.frame(x,y)
# loglikelihood function
loglikelihood<-function(b,df){
prd<-1
for (i in 1:NROW(df)){
events<-logit(df$x[i],b)
nonevents<-1-events
prd<-prd*events^df$y[i]*nonevents^(1-df$y[i])
}
return(sum(log(prd)))
}
loglikelihood(0.3,df)
p2<-ggplot(data=data.frame(b=c(-5,5)), aes(b)) + stat_function(fun=loglikelihood, args=list(df=df))
p2<-p2+xlab("b") + ylab("loglikelihood")
p2
最佳答案
问题出在你的对数似然函数上。您必须将“向量化”函数传递给 stat_function。如果传入向量,R 中的大多数函数都会返回向量。例如,sin(1:10
) 将返回数字 1 到 10 的正弦值。但是,当将值向量传递给函数时,仅返回一个值
loglikelihood(seq(-5,5, by=.1), df)
# [1] -20534.44
由于它的行为不像“正常”R 函数,因此您会遇到这个问题。解决此问题的最简单方法是将函数定义包装在 Vectorize
命令中。观察
vloglikelihood <- Vectorize(loglikelihood, vectorize.args="b")
vloglikelihood(seq(-5,5, by=.1), df)
# [1] -463.67919 -454.67142 -445.66980 -436.67470 -427.68654 -418.70574 ...
现在,它的 vloglikelihood
的行为就像一个好的 R 函数应该的那样。然后我们可以像您一样绘制它
ggplot(data=data.frame(b=c(-5,5)), aes(b)) +
stat_function(fun=vloglikelihood, args=list(df=df)) +
xlab("b") + ylab("loglikelihood")
关于r - ggplot2 stat_function 绘制了错误的函数,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/24421217/
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