r - 调试 R 中加载的 Rcpp 编译代码(在 OS X Mavericks 上)有哪些有效方法？

Question

调试加载到 R 中的共享对象(尤其是在 OS X Mavericks 上)最高效、最快捷的方法是什么？我主要对调试编译的 Rcpp 代码感兴趣。

我已阅读有关调试编译代码的 R 外部内容 ( http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Debugging-compiled-code )，它倾向于使用 gdb，但 Mavericks 并未正式支持 gdb。然而，lldb 似乎是一个可行的替代方案？我从 Dirk 对这篇文章的回复中找到了关于如何在 R 中调试编译代码的最有用的资源(感谢 Dirk!)( Debugging (line by line) of Rcpp-generated DLL under Windows )。

我可以按照我在下面明确概述的步骤成功地调试编译的 Rcpp 代码，其他 Rcpp 新手可能会发现这很有用(对长度表示歉意，但我认为清楚比省略和被忽略更好)模糊的)。但这个开发过程有点繁琐且耗时。

问题:

1. 与我下面所做的相比，是否有更快和/或更简单的方法来调试已编译的 Rcpp 代码？

2. 我是 Rstudio 的忠实粉丝，并且希望合并从该 IDE 创建的调试共享对象，所以如果有人知道如何做到这一点，我有兴趣知道吗？ Rstudio似乎使用了属性，看来下面的步骤4需要修改，因为编译后临时目录中似乎没有.cpp文件(在我下面的示例中，没有“file5156292c0b48.cpp”文件)

步骤:

1) (一次性)转到目录 ~/.R(带有 . 的隐藏目录)。创建一个名为“Makevars”的新文件，并在其中添加行 CXXFLAGS=-g -O0 -Wall。

2) 在终端中，输入 R -d lldb 启动 R。lldb 现在将启动。

3) 在 lldb 命令行中输入 run。这将启动 R。

4) 编译Rcpp代码并找到编译对象的位置。德克对上述帖子的回应展示了一种实现此目的的方法。这是我将在这里使用的一个示例。在 R 中运行以下命令:

library(inline)

fun <- cxxfunction(signature(), plugin="Rcpp", verbose=TRUE, body='
int theAnswer = 1;
int theAnswer2 = 2;
int theAnswer3 = 3;
double theAnswer4 = 4.5;
return wrap(theAnswer4);
')

这会创建一个已编译的共享对象和其他文件，可以通过在 R 中运行 setwd(tempdir()) 和 list.files() 来找到这些文件。将会有一个 .cpp 文件，例如“file5156292c0b48.cpp”和 .so像“file5156292c0b48.so”这样的文件

5) 通过在 R 命令行运行 dyn.load("file5156292c0b48.so") 将共享对象加载到 R 中

6) 现在我们要调试这个 .so 对象中的 C++ 代码。按 ctrl + c 返回 lldb。现在我想在 file5156292c0b48.cpp 文件中的特定行设置断点。我通过打开另一个终端并查看 file5156292c0b48.cpp 中感兴趣的行号来找到正确的行号。假设是第 31 行，对应于 int theAnswer = 1; 行上面我的例子。然后，我在 lldb 命令行中输入:breakpoint set -f file5156292c0b48.cpp -l 31。调试器打印回断点已设置以及其他一些内容...

7) 通过在 lldb 中运行 cont 返回到 R(在我按下 Enter 键之前，R 提示符不会自动出现)并调用该函数。在 R 命令行运行 fun()。现在我正在调试共享对象(按 n 转到下一行，按 p [对象名称] 打印变量等)....

Answer 1

要调试像这样的简单 Rcpp 脚本，您可以做的一件事是创建一个嵌入 R 的 .cpp 应用程序(带有 main)。这样您就可以直接使用 Xcode 进行调试，这将给出为您带来良好的调试体验。

当您开始想要调试包时，事情会变得更加复杂。