滚动应用于向量的子集

Question

我想将一个函数应用于 R 中向量的渐进子集。我已经查看了我能找到的内容，并且 apply 和 Friends 并不完全存在，并且 rollapply 不适用于直向量，仅适用于 Zoo/ts 对象。

vapply <- function(x, n, FUN=sd) {
    v <- c(rep(NA, length(x)))
    for (i in n:length(x) ) {  
        v[i] <- FUN(x[(i-n+1):i])
    }
    return(v)
}

是否有内置的等效内容？有更好的方法吗？我试图避免对第三方库的依赖，因为代码需要独立才能分发。

Answer 1

根据您选择的函数名称，我只需制作一个在内部实际使用 vapply 的版本:)...在下面的示例中，速度大约快了 50%。但这当然很大程度上取决于 FUN 中完成了多少工作......

# Your original version - renamed...
slideapply.org <- function(x, n, FUN=sd) {
    v <- c(rep(NA, length(x)))
    for (i in n:length(x) ) {  
        v[i] <- FUN(x[(i-n+1):i])
    }
    return(v)
}

slideapply <- function(x, n, FUN=sd, result=numeric(1)) {
    stopifnot(length(x) >= n) 
    FUN <- match.fun(FUN)
    nm1 <- n-1L
    y <- vapply(n:length(x), function(i) FUN(x[(i-nm1):i]), result)

    c(rep(NA, nm1), y) # Why do you want NA in the first entries?
}

x <- 1:2e5+0 # A double vector...
system.time( a <- slideapply.org(x, 50, sum) )  # 1.25 seconds
system.time( b <- slideapply(x, 50, sum) )      # 0.80 seconds
identical(a, b) # TRUE