python-2.7 - 使用VTK转换DICOM图像

Question

我需要将 DICOM 图像转换为 JPG/PNG 并使用 VTK 保存图像，但我生成的图像与原始图像不匹配。

我知道我需要重新缩放图像的像素来转换它，但我不知道如何。有谁知道我如何才能正确进行转换？

下面是我的 python 代码:

from vtk import *

reader = vtkDICOMImageReader()
reader.SetFileName('image.dcm')
reader.Update()

castFilter = vtkImageCast()
castFilter.SetOutputScalarTypeToUnsignedChar()
castFilter.SetInputConnection(reader.GetOutputPort())
castFilter.Update()

writer = vtkJPEGWriter()
writer.SetFileName('output.jpg')
writer.SetInputConnection(castFilter.GetOutputPort())
writer.Write()

Answer 1

MRI 和 CT 模式中的 DICOM 通常是短类型，并且您将图像无情地转换为 unsigned char。如果您尝试获取相应的 uchar 图像，则应该使用 vtkImageShiftScale，就像 vtkImageCast 文档所述:

Warning As vtkImageCast only casts values without rescaling them, its use is not recommented. vtkImageShiftScale is the recommented way to change the type of an image data.