R:ggfortify: "Objects of type prcomp not supported by autoplot"

Question

我正在尝试使用 ggfortify 来可视化我使用 prcomp 所做的 PCA 结果。

示例代码:

iris.pca <- iris[c(1, 2, 3, 4)] 
autoplot(prcomp(iris.pca))  

Error: Objects of type prcomp not supported by autoplot. Please use qplot() or ggplot() instead.

奇怪的是，autoplot 是专门为处理 prcomp 的结果而设计的 - ggplot 和 qplot 无法处理这样的对象。我正在运行 R 版本 3.2，今天上午刚刚从 github 下载了 ggfortify。

谁能解释一下这个消息？

Answer 1

我猜你没有加载所需的库，代码如下:

library(devtools)
install_github('sinhrks/ggfortify')
library(ggfortify); library(ggplot2)
data(iris)
iris.pca <- iris[c(1, 2, 3, 4)] 
autoplot(prcomp(iris.pca))

可以工作