r - JRI 可以访问 Vista 上用户安装的软件包吗？

Question

我开发了一个 Java 应用程序，它使用 JRI 来利用 ptw 包。

在 Linux(Ubuntu 10.04、R 2.10.1、JRI 0.5.0)上运行良好。

但是，在 Vista(R 2.12.0、JRI 0.5.0)上，当应用程序评估“library(ptw)”时，会发生以下错误:

库(ptw)中的错误:找不到对象“ptw”

当我从 Vista 命令行运行 R 并发出“library(ptw)”命令时，没有问题。

如果我将 ptw 包从 %USERPROFILE%\Documents\R\win-library 复制到 %R_HOME%\library，那么问题就会消失。但是，我不希望我的用户必须这样做，事实上，有些人可能没有这样做的权限。

因此，如何让 JRI 调用 R-Engine，该 R-Engine 可以访问用户已安装在其设备中的包%USERPROFILE%\Documents\R\win-library？

我也 asked在 r-help 邮件列表上，但没有什么乐趣。

我知道library()函数的libloc参数，但我更喜欢一些不太脆弱的东西，即自动而不是需要配置......

Answer 1

如果位置与默认位置不同，则应在 Rprofile.site 文件中提及它们，其中使用 .libPaths() 或 .Library.site 变量已设置。检查您是否可以在 R 版本的 Rprofile.site 文件中找到让您的应用程序打印函数 .libPaths() 的输出。

据我所知(但我可能是错的)，JRI 使用 Rserve，它不会以经典方式启动 R。我怀疑在 Windows 上这会以某种方式忘记 Rprofile.site (这实际上是一个错误)。看不出它不起作用的其他原因，但我不是专家。

一种解决方案是:

• 从一开始就获取 Rprofile.site。
• 或将任何可能的位置添加到.libPaths()(请参阅?.libPaths)
• 或在脚本中自行设置.Library.site变量

您可能想检查问题在 Windows 7 上是否仍然存在，因为我注意到使用 Vista 时某些程序尝试连接到 R 时出现问题，而同一版本在 Windows 7 上运行良好。