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Rcpp - 加速 for 和 while 循环内的随机正常绘制

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 08:55:03 25 4
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我是 Rcpp 新手,正在探索它的应用程序。特别是,我正在尝试加速以下功能,该功能部分构建于 previous answer :

code = 'NumericVector RcppFun(int N){
NumericVector out(N);
for (int i = 0; i < N; ++i) {
double V = 0;
while( V > -1e04 && V < 1e04 ) {
V += R::rnorm(10, 100);
}
out[i] = V;
}
return out;
}'
cppFunction(code)
system.time(RcppFun(1e05))

该代码比 R 对应的代码快得多,但在我的计算机上运行仍需要几秒钟。鉴于我需要多次调用这个函数,我想知道是否可以进一步提高它的性能。

我认为修改 while 循环内的逻辑语句或更改 RNG 函数会以某种方式使函数更快,但我不知道如何实现。

谢谢您的建议!

编辑:为了完整起见,这里是我根据 Dirk 非常有用的建议用 C++ 编写的代码:

#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::depends(RcppZiggurat)]]
#include <Ziggurat.h>
using namespace Rcpp;
static Ziggurat::Ziggurat::Ziggurat zigg;
// [[Rcpp::export]]
NumericVector ZiggFun(int N){
NumericVector out(N);
for (int i = 0; i < N; ++i) {
double V = 0;
while( V > -1e04 && V < 1e04 ) {
V += 10 + zigg.norm()*100;
}
out[i] = V;
}
return out;
}

根据 rbenchmark::benchmark 估计,新代码现在速度快了 7 倍以上!

最佳答案

您可以使用 RcppZiggurat 进行更快的 RNG 抽签——我在包中进行了时间比较:

R> library(RcppZiggurat)
R> library(microbenchmark)
R> microbenchmark(rnorm(1e5), zrnorm(1e5))
Unit: microseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
rnorm(1e+05) 6148.781 6169.917 6537.31 6190.073 6923.357 10166.96 100 b
zrnorm(1e+05) 719.458 887.554 1016.03 901.182 939.652 2880.47 100 a
R>

这个 RNG 也可以在 C++ 级别的其他包中使用。它只是您以通常方式拉取的 header 。

关于Rcpp - 加速 for 和 while 循环内的随机正常绘制,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/46698194/

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