python - conda env 无法创建新环境

Question

当尝试创建 viper 工具的新环境时，我在解决包规范时陷入困境。

我已经从他们的 website 下载了该工具并打开包装。按照说明，我尝试创建一个名为 viper 的 conda 环境。

使用命令

conda env create -f environment.yml -n viper

如上所述，该过程陷入困境。所以我尝试了

conda create --file environment.yml -n viper

但我收到错误

CondaValueError: could not parse 'name: viper' in: environment.yml

我的environment.yml文件的标题附在下面

 name: viper
 channels: #!!python/tuple
     - bioconda
     - conda-forge
     - defaults
 dependencies:
     - ...

我做错了什么？

我的 conda 版本是这样的:

 $ conda info
 Current conda install:

           platform : linux-64
      conda version : 4.3.30
   conda is private : False
  conda-env version : 4.3.30
conda-build version : not installed
     python version : 3.6.3.final.0
   requests version : 2.18.4
   root environment : /home/yeroslaviz/miniconda3  (writable)
default environment : /home/yeroslaviz/miniconda3
   envs directories : /home/yeroslaviz/miniconda3/envs
                      /home/yeroslaviz/.conda/envs
      package cache : /home/yeroslaviz/miniconda3/pkgs
                      /home/yeroslaviz/.conda/pkgs
       channel URLs : https://repo.continuum.io/pkgs/main/linux-64
                      https://repo.continuum.io/pkgs/main/noarch
                      https://repo.continuum.io/pkgs/free/linux-64
                      https://repo.continuum.io/pkgs/free/noarch
                      https://repo.continuum.io/pkgs/r/linux-64
                      https://repo.continuum.io/pkgs/r/noarch
                      https://repo.continuum.io/pkgs/pro/linux-64
                      https://repo.continuum.io/pkgs/pro/noarch
        config file : None
         netrc file : None
       offline mode : False
         user-agent : conda/4.3.30 requests/2.18.4 CPython/3.6.3 Linux/4.4.0-72-generic debian/stretch/sid glibc/2.23    
            UID:GID : 1000:1000

谢谢

Answer 1

conda create --fileenvironment.yml -n viper 不起作用。此命令尝试将 environment.yml 中的每一行解析为包名称。

您应该使用conda env create --fileenvironment.yml -n viper。

请耐心等待冲突解决完成。