R 有效地填充向量

Question

我有一个相当大的矢量(长度 >500,000)。它包含一堆 NA 穿插在 1 中，并且始终保证它以 1 开头。

我想根据对另一个向量的连续索引的比较操作，用 1 替换 v1 中的一些 NA v2(与v1长度相同)。

是否有一种有效的方法可以在矢量化符号中执行此操作，以便在低级实现中完成循环？也许使用 ifelse？

下面的可重现示例:

v1<-c(1,NA,NA,NA,1,NA,NA,NA,NA,NA,1,NA,NA,1,NA,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,1)
v2<-c(10,10,10,9,10,9,9,9,9,9,10,10,10,11,8,12,12,12,12,12,12,12,12,12,12,13)
# goal is to fill through v1 in such a way that whenever 
# v1[i] == NA and v1[i-1] == 1 and v2[i] == v2[i-1], then v1[i] == 1
MM<-data.frame(v1,v2)
for (i in 2:length(v1)){ 
    # conditions: v1[i-1] == 1; v1[i]==NA; v2[i]==v2[i-1]
    if (!is.na(v1[i-1]) && is.na(v1[i]) && v2[i]==v2[i-1]){
        v1[i]<-1
    }
}
MM$v1_altered<-v1
MM

Answer 1

可能有更快的解决方案，但这是我能在几分钟内想到的最佳解决方案。对于小向量，我的解决方案比 OP 慢，但对于更大的向量，速度越来越快。

library(zoo)  # for na.locf
library(rbenchmark)

v1<-c(1,NA,NA,NA,1,NA,NA,NA,NA,NA,1,NA,NA,1,NA,1,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,NA,1)
v2<-c(10,10,10,9,10,9,9,9,9,9,10,10,10,11,8,12,12,12,12,12,12,12,12,12,12,13)
V1 <- rep(v1, each=20000)  # 520,000 observations
V2 <- rep(v2, each=20000)  # 520,000 observations

fun1 <- function(v1,v2) {
  for (i in 2:length(v1)){ 
    if (!is.na(v1[i-1]) && is.na(v1[i]) && v2[i]==v2[i-1]){
      v1[i]<-1
    }
  }
  v1
}
fun2 <- function(v1,v2) {
  # create groups in which we need to assess missing values
  d <- cumsum(as.logical(c(0,diff(v2))))
  # for each group, carry the first obs forward
  ave(v1, d, FUN=function(x) na.locf(x, na.rm=FALSE))
}
all.equal(fun1(V1,V2), fun2(V1,V2))
# [1] TRUE
benchmark(fun1(V1,V2), fun2(V1,V2))
#           test replications elapsed relative user.self sys.self
# 1 fun1(V1, V2)          100  194.29 6.113593    192.72     0.17
# 2 fun2(V1, V2)          100   31.78 1.000000     30.74     0.95