r - 加快 R 中的概率加权采样-6ren

r - 加快 R 中的概率加权采样

转载作者：行者123 更新时间：2023-12-02 08:36:04

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如何在 R 中加快概率加权采样。

# Let's assume we are considering following example:
w <- sample(1:4000,size=2e6, replace=T)   

# "w" will be integer, so we are going to convert it to numeric.
w <- as.numeric(w)

# Actually the sampling process have to be repeated many times.
M <- matrix(NA, 10, 2000)
system.time(
for (r in 1:10){
  ix <- sample(1:2e6,size=2000,prob=w/sum(w))
  M[r,] <- ix
})
# It's worth it to mention that without "prob=w/sum(w)" sampling is considerably faster.
# The main goal is to speed up sampling with probability weights!
system.time(ix <- sample(1:2e6,size=2000,prob=w/sum(w)))

加权采样需要 9.84 秒，正常采样需要 0.01 秒。如果您对如何加快加权采样有任何想法，欢迎回答。

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