awk - 将行追加到上一行

Question

我试图将所有以 > 开头的行附加到不以 > 开头的前一行

cat tmp

ATAAACGGAAAAACACTACTTTAGCTTACGGGATCCGGT
>Aa_816
>Aa_817
>Aa_818
CCAAACGGAAAAACACTACTTGAGCTTACGGGATCCGGT
>Aa_940
>Aa_941
CTAAAAGGAAAAACACTACTTTAGCTTTTGGGATCCGGT

我想要的是:

ATAAACGGAAAAACACTACTTTAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_816 >Aa_817 >Aa_818
CCAAACGGAAAAACACTACTTGAGCTTACGGGATCCGGT >Aa_940 >Aa_941
CTAAAAGGAAAAACACTACTTTAGCTTTTGGGATCCGGT

这几乎让我到达那里:

cat tmp |awk '!/>/ {sub(/\\$/,""); getline t; print $0 t; next}; 1'

Answer 1

使用awk:

awk '!/^>/{printf "%s%s", (NR==1)?"":RS,$0;next}{printf "%s", FS $0}END{print ""}' file