- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我正在尝试创建一个包含 GGally 图的列表对象。这些图均由两个数据集创建,即主数据集和要再次以橙色绘制的主数据集的子集。在下面的 MWE 中,创建了三个图,每个图都比较 mtcars 数据中的两列,每个图都包含要以橙色绘制的不同数量的子集点:
Plot_1:mpg 和 cyl,1 个橙色覆盖点
Plot_2:mpg 和 disp,20 个橙色重叠点
Plot_3:英里/加仑和马力,30 个橙色叠加点
library(GGally)
library(ggplot2)
data = mtcars
data$ID = rownames(mtcars)
data = data[, c(12,1:11)]
my_fn <- function(data, mapping, ...){
xChar = as.character(mapping$x)
yChar = as.character(mapping$y)
x = data[,c(xChar)]
y = data[,c(yChar)]
p <- ggplot(data, aes(x=x, y=y)) + geom_point() + geom_point(data = colorData, aes_string(x=xChar, y=yChar), inherit.aes = FALSE)
p
}
ret=list()
colorVec = c(1, 10, 20)
k=1
for (j in c(3:5)){
datSel <- cbind(ID=data$ID, data[,c(2, j)])
datSel$ID = as.character(datSel$ID)
colorData <- datSel[sample(1:nrow(data), colorVec[k]),]
p <- ggpairs(datSel[,-1], lower = list(continuous = my_fn), upper = list(continuous = wrap("cor", size = 4))) + theme_gray()
ret[[paste0("Plot_",j)]] <- p
k=k+1
}
但是,当我运行此代码并创建 ret 列表对象时,只有列表中的最后一个绘图对象成功创建了绘图。前两个列表对象无法找到数据中的某一列。
> ret[["Plot_1"]]
Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'cyl' not found
> ret[["Plot_2"]]
Error in FUN(X[[i]], ...) : object 'disp' not found
> ret[["Plot_3"]]
Correctly plotted
什么是解决此问题的无痛方法?预先感谢您分享建议。
编辑:
添加 session 信息以提高重现性
> sessionInfo()
R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: macOS Sierra 10.12.6
Matrix products: default
BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] ggplot2_2.2.1 GGally_1.3.2
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_0.12.15 reshape_0.8.7 grid_3.4.3 plyr_1.8.4 gtable_0.2.0
[6] magrittr_1.5 scales_0.5.0 pillar_1.2.1 stringi_1.1.6 rlang_0.2.0
[11] reshape2_1.4.3 lazyeval_0.2.1 labeling_0.3 RColorBrewer_1.1-2 tools_3.4.3
[16] stringr_1.3.0 munsell_0.4.3 yaml_2.1.17 compiler_3.4.3 colorspace_1.3-2
[21] tibble_1.4.2
最佳答案
如果我正确理解你的问题,可能的解决方案:
library(GGally)
data = mtcars
data$ID = rownames(mtcars)
data = data[, c(12,1:11)]
# Load tidyverse
library(tidyverse)
# Create a vector list for each plot you want
var_list <- data.frame(var = names(data)[3:5],
color = colorVec)
# Function for sampling orange points
my_color_fn <- function(data, color_nb) {
sample(1:nrow(data), color_nb)
}
# Create a list with a data for each variable with colors
data_list <- apply(var_list, 1,
function(x)
data %>%
select(ID, mpg, as.character(x[["var"]])) %>%
mutate(color = "black") %>%
mutate(color = replace(color, my_color_fn(., x[["color"]]), "orange")))
# Update my_fn function
my_fn <- function(data, mapping, ...){
xChar = as.character(mapping$x)
yChar = as.character(mapping$y)
x = data[, c(xChar)]
y = data[, c(yChar)]
p <- ggplot(data, aes_string(x=x, y=y)) +
geom_point(aes(color = color)) +
scale_color_manual("", values = c("black" = "black",
"orange" = "orange"))
p
}
# Create a function to get ggpairs for each subset
my_fn2 <- function(data)
{
p <- ggpairs(data %>% select(- ID), 1:2,
lower = list(continuous = my_fn),
upper = list(continuous = wrap("cor", size = 4)))
return(p)
}
# Get plot for each list element
ret <- lapply(data_list, function(x) my_fn2(x))
ret[[1]]
ret[[2]]
ret[[3]]
关于r - 将定制的 ggpairs() 绘图对象累积到列表对象中,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/49470599/
我正在从 Stata 迁移到 R(plm 包),以便进行面板模型计量经济学。在 Stata 中,面板模型(例如随机效应)通常报告组内、组间和整体 R 平方。 I have found plm 随机效应
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 6年前关闭。 Improve this qu
我想要求用户输入整数值列表。用户可以输入单个值或一组多个值,如 1 2 3(spcae 或逗号分隔)然后使用输入的数据进行进一步计算。 我正在使用下面的代码 EXP <- as.integer(rea
当 R 使用分类变量执行回归时,它实际上是虚拟编码。也就是说,省略了一个级别作为基础或引用,并且回归公式包括所有其他级别的虚拟变量。但是,R 选择了哪一个作为引用,以及我如何影响这个选择? 具有四个级
这个问题基本上是我之前问过的问题的延伸:How to only print (adjusted) R-squared of regression model? 我想建立一个线性回归模型来预测具有 15
我在一台安装了多个软件包的 Linux 计算机上安装了 R。现在我正在另一台 Linux 计算机上设置 R。从他们的存储库安装 R 很容易,但我将不得不使用 安装许多包 install.package
我正在阅读 Hadley 的高级 R 编程,当它讨论字符的内存大小时,它说: R has a global string pool. This means that each unique strin
我们可以将 Shiny 代码写在两个单独的文件中,"ui.R"和 "server.R" , 或者我们可以将两个模块写入一个文件 "app.R"并调用函数shinyApp() 这两种方法中的任何一种在性
我正在使用 R 通过 RGP 包进行遗传编程。环境创造了解决问题的功能。我想将这些函数保存在它们自己的 .R 源文件中。我这辈子都想不通怎么办。我尝试过的一种方法是: bf_str = print(b
假设我创建了一个函数“function.r”,在编辑该函数后我必须通过 source('function.r') 重新加载到我的全局环境中。无论如何,每次我进行编辑时,我是否可以避免将其重新加载到我的
例如,test.R 是一个单行文件: $ cat test.R # print('Hello, world!') 我们可以通过Rscript test.R 或R CMD BATCH test.R 来
我知道我可以使用 Rmd 来构建包插图,但想知道是否可以更具体地使用 R Notebooks 来制作包插图。如果是这样,我需要将 R Notebooks 编写为包小插图有什么不同吗?我正在使用最新版本
我正在考虑使用 R 包的共享库进行 R 的站点安装。 多台计算机将访问该库,以便每个人共享相同的设置。 问题是我注意到有时您无法更新包,因为另一个 R 实例正在锁定库。我不能要求每个人都关闭它的 R
我知道如何从命令行启动 R 并执行表达式(例如, R -e 'print("hello")' )或从文件中获取输入(例如, R -f filename.r )。但是,在这两种情况下,R 都会运行文件中
我正在尝试使我当前的项目可重现,因此我正在创建一个主文档(最终是一个 .rmd 文件),用于调用和执行其他几个文档。这样我自己和其他调查员只需要打开和运行一个文件。 当前设置分为三层:主文件、2 个读
关闭。这个问题不符合Stack Overflow guidelines .它目前不接受答案。 想改进这个问题?将问题更新为 on-topic对于堆栈溢出。 5年前关闭。 Improve this qu
我的 R 包中有以下描述文件 Package: blah Title: What the Package Does (one line, title case) Version: 0.0.0.9000
有没有办法更有效地编写以下语句?accel 是一个数据框。 accel[[2]]<- accel[[2]]-weighted.mean(accel[[2]]) accel[[3]]<- accel[[
例如,在尝试安装 R 包时 curl作为 usethis 的依赖项: * installing *source* package ‘curl’ ... ** package ‘curl’ succes
我想将一些软件作为一个包共享,但我的一些脚本似乎并不能很自然地作为函数运行。例如,考虑以下代码块,其中“raw.df”是一个包含离散和连续类型变量的数据框。函数“count.unique”和“squa
我是一名优秀的程序员,十分优秀!