Python 在 "SystemExit: 1"上引发异常 "sys.exit ( 1 )"

Question

我正在从此链接运行 simpleitk 的 python 示例 https://simpleitk.readthedocs.io/en/master/Examples/ImageRegistrationMethod1/Documentation.html

在spyder anaconda中。

我已经通过 anaconda Prompt 安装了软件包 simpleitk,system,os 。

from __future__ import print_function

import SimpleITK as sitk
import sys
import os


def command_iteration(method) :
    print("{0:3} = {1:10.5f} : {2}".format(method.GetOptimizerIteration(),
                                   method.GetMetricValue(),
                                   method.GetOptimizerPosition()))

if len ( sys.argv ) < 4:
    print( "Usage: {0} <fixedImageFilter> <movingImageFile> <outputTransformFile>".format(sys.argv[0]))
cc


fixed = sitk.ReadImage(sys.argv[1], sitk.sitkFloat32)
print(sys.argv[1])
moving = sitk.ReadImage(sys.argv[2], sitk.sitkFloat32)

R = sitk.ImageRegistrationMethod()
R.SetMetricAsMeanSquares()
R.SetOptimizerAsRegularStepGradientDescent(4.0, .01, 200 )
R.SetInitialTransform(sitk.TranslationTransform(fixed.GetDimension()))
R.SetInterpolator(sitk.sitkLinear)

R.AddCommand( sitk.sitkIterationEvent, lambda: command_iteration(R) )

outTx = R.Execute(fixed, moving)

print("-------")
print(outTx)
print("Optimizer stop condition: {0}".format(R.GetOptimizerStopConditionDescription()))
print(" Iteration: {0}".format(R.GetOptimizerIteration()))
print(" Metric value: {0}".format(R.GetMetricValue()))

sitk.WriteTransform(outTx,  sys.argv[3])

if ( not "SITK_NOSHOW" in os.environ ):

    resampler = sitk.ResampleImageFilter()
    resampler.SetReferenceImage(fixed);
    resampler.SetInterpolator(sitk.sitkLinear)
    resampler.SetDefaultPixelValue(100)
    resampler.SetTransform(outTx)

    out = resampler.Execute(moving)
    simg1 = sitk.Cast(sitk.RescaleIntensity(fixed), sitk.sitkUInt8)
    simg2 = sitk.Cast(sitk.RescaleIntensity(out), sitk.sitkUInt8)
    cimg = sitk.Compose(simg1, simg2, simg1//2.+simg2//2.)
    sitk.Show( cimg, "ImageRegistration1 Composition" )

运行此代码时，出现以下错误用法:E:/registration/simpleitk.py发生异常，使用 %tb 查看完整的回溯。

SystemExit: 1

C:\Users\aBC\AppData\Local\Continuum\anaconda3\lib\site-packages\IPython\core\interactiveshell.py:3275: UserWarning: To exit: use 'exit', 'quit', or Ctrl-D. warn("To exit: use 'exit', 'quit', or Ctrl-D.", stacklevel=1)

我该如何纠正这个错误？

Answer 1

我怀疑脚本无法在调用 satk.ReadImage 时加载图像。它期望在 sys.argv[1] 变量中提供文件名。该脚本设计为在命令行上运行，并使用作为命令行参数提供的固定图像文件名、移动图像文件名和输出转换文件名。

如果您无法在 Spyder 中提供命令行参数(我不知道；我对它不熟悉)，您可以在脚本中对文件名进行硬编码。

如果您对 SimpleITK 有更多疑问，我建议查看 ITK Discourse，discourse.itk.org。