r - 阴谋无处

Question

我正在使用 limma 包的函数 plotMDS()，它通过 R 的简单 plot() 格式绘制图，并且还返回图上点的位置作为输出。我想使用 plotMDS() 的输出来制作我自己的美丽情节。

有什么方法可以运行 plotMDS() 而不真正生成它的绘图？我这样问的原因是我已经将输出转换为 PDF 文件并且我不希望 plotMDS() 的原始图在那里!

Answer 1

感谢@BenBolker，可以这样做:

pdf("Some file")
...
dev.new() # Putting new plots to nowhere
mds <- plotMDS(data)
dev.off() # Restoring new plots to the PDF file
plot(...) # Making the desired plot using mds
...
dev.off() # Closing PDF file