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>seq1
AAATTCCGTACGGGCCTCT
>seq2
TGGAATCACAGCGGCGTACGCAGCGGCGGCTGCGGCCGTACGGCG
>seq3
AATGCCAAACGTACGAACAT
在示例中，输出将是(因为序列“CGTACG”出现了两次):
>seq2
TGGAATCACAGCGGCGTACGCAGCGGCGGCTGCGGCCGTACGGCG
最佳答案
您只需要:
awk '/^>/{seq=$0} gsub(/CGTACG/,"&") > 1{print seq ORS $0}' file
关于unix - 查找在同一行中多次出现某种模式的文件，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/59688190/
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