R 警告 : Mistake in factor

Question

我的 R 代码是:

means_log_adj <- aggregate(lab_data[,delta_touse], 
    by = list(
        factor(mydata_adj$Response_EP, labels = c("non_responder", "responder")), 
        factor(mydata_adj$sex,labels = c("male","female")), 
        factor(mydata_adj$timepoint,labels = c("baseline","wk1","wk2","EP"))),
    mean)

Warning message: 
> mistake in factor
> (mydata_adj$Response_EP, labels =
> c("non-responder", "responder")):
> invalid labels; length 2 should be 1
> or 0.

谁能帮我解决我的问题？

Answer 1

经过反复试验，我成功地重现了您的问题。

但首先要说的是，R 中的warning 和error 之间有一个非常重要的区别。当你报告问题时，一定要区分清楚两者之间。

x <- letters[1:5]
factor(x, labels=LETTERS[1:10])

Error in factor(x, labels = LETTERS[1:10]) : 
  invalid labels; length 10 should be 1 or 5

发生此错误是因为您告诉 factor() 使用不存在的级别重新标记数据。我为一个只包含 5 个级别的变量指定了 10 个标签。这意味着标签和级别不匹配。

有两种方法可以解决这个问题:

第一种是让R 确定级别，并简单地调用factor(x) 而不带任何参数。 (猜测，这可能是您应该在代码中完成的。):

factor(x)
[1] a b c d e
Levels: a b c d e

第二个是调用 factor(x) 并指定 levels，而不是 labels:

factor(x, levels=letters[1:10])
[1] a b c d e
Levels: a b c d e f g h i j

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您尚未提供示例数据，因此我们无法测试解决方案。但是试试下面的代码:

means_log_adj <- aggregate(lab_data[,delta_touse], 
    by = list(
        factor(mydata_adj$Response_EP,), 
        factor(mydata_adj$sex), 
        factor(mydata_adj$timepoint)),
    mean)