RStudio、Packrat 和 Knir

Question

我在 RStudio 工作。我首先在项目中创建了一个knitr文件，并且编译pdf工作完美。然后，当我处理不同的文件时，我为该项目激活了 packrat。 (后来又停用了)

现在，当我再次尝试 Knit(编译 pdf)我的 .Rnw 文件时，我得到了

Initializing packrat project in directory:
- "mydir"
Error in appDependencies(project) : 
  could not find function "available.packages"
Calls: source ... sort_c -> with_collate -> force -> sort -> appDependencies
Execution halted

我检查了 RStudio 的项目选项，但未选中 packrat。从 Knit 改为 Sweave 没有帮助。另外，我确保安装了knitr。

我能做什么？

Answer 1

如果您为项目激活了 Packrat，并且由于某种原因 packrat::disable() 没有清除生成的 .Rprofile，您可能需要将其删除手动。

如果您的项目的基本目录中有一个.Rprofile，并且它包含例如

#### -- Packrat Autoloader (version 0.4.1.24) -- ####
source("packrat/init.R")
#### -- End Packrat Autoloader -- ####

您需要删除该位。

或者，您可以确保在小插图中加载 utils(available.packages 是 utils 中的函数)；例如与库(utils)。