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r - 使用变量作为 R 中的列名拟合 glm

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-02 05:42:26 26 4
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我想装一个 glm()在 R 中使用变量而不是列名,但它不起作用。这可以帮助我自动生成 glms。当我适合 glm使用列名,程序运行良好,当我将列名与包含列名的变量交换时,程序给出并出错。

这是我的命令的样子:

##The data
mydata <- structure(list(var1 = c(10L, 100L, 50L, 40L, 20L, 50L, 60L, 55L,
45L), var2 = c(1.5, 1.2, 1, 1.4, 1.2, 1.4, 1.3, 1.4, 1.3), var3 = c(5L,
3L, 4L, 1L, 5L, 2L, 7L, 5L, 4L), group = structure(c(1L, 1L,
2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L), .Label = c("A", "B"), class = "factor")), .Names = c("var1",
"var2", "var3", "group"), class = "data.frame", row.names = c(NA,
-9L))
## My variable
x <- c("var1+var2")
##Fitting the model
myglm <- glm(formula = group ~ var1+var2 , family = "binomial", data = mydata) ## works fine


myglm2 <- glm(formula = group ~ x , family = "binomial", data = mydata)
Error in model.frame.default(formula = group ~ x, data = mydata, drop.unused.levels = TRUE) :
variable lengths differ (found for 'x')

我尝试使用 paste(x)cat(x)功能,但它没有工作。
可以在 R 中做到这一点吗?我需要使用这个,因为我赚了大约 1000 glm在 for 循环中。

最佳答案

使用 as.formula 更轻松地进行编辑:

valid.names <- names(mydata)[names(mydata) != "group"]  # all but group
for(i in 2:length(valid.names)) {
frm <- as.formula(paste("group ~", valid.names[i - 1], "+" , valid.names[i]))
myglm <- glm(formula = frm, family = "binomial", data = mydata) ## works fine
}

旧版本

这是使用 parse 的潜在解决方案:
valid.names <- names(mydata[, -4])  # all but group
frm <- group ~ x
for(i in 2:length(valid.names)) {
varplusvar <- parse(text=paste(valid.names[i - 1], "+" , valid.names[i]))[[1]]
frm[[3]] <- varplusvar
myglm <- glm(formula = frm, family = "binomial", data = mydata) ## works fine
}

关于r - 使用变量作为 R 中的列名拟合 glm,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/21384303/

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