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在开展项目时，我需要下载和处理 PubMed 摘要的全文文章，是否有任何实现的代码或工具允许用户输入一组 PubMed id 并下载相同的免费全文文章。非常感谢任何类型的帮助或提示。
最佳答案
由于 PubMed 的性质，我认为一般来说这是不可能的。您要做的最好的事情就是从 PubMedCentral 的开放获取子集获取文章。 PubMedCentral 有一个 number of online utilities为了完成这项工作。
关于pdf - PubMed 文章的全文 PDF，我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题： https://stackoverflow.com/questions/4693226/
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这是 this 的后续问题问题。 同样的想法:我从 PubMed 中提取 XML 数据，并使用curl 来处理这些结果。这使我能够获取所需的信息(酒吧 ID 列表)并将其用作另一个 PubMed 抓取
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我在从以下查询获取摘要时遇到问题 Entrez.email = "anonymous@gmail.com" esearch_query = Entrez.esearch(db="pubmed", te
我正在开展一个项目，我必须构建 SVM 分类器来根据文章标题和摘要中的单词来预测 MeSH 术语分配。我们获得了包含 1000 个 PMID 的 gzip 文件，用于标识每篇文章。下面是一个示例文件:
我正在使用 BioPython 通过 eutils API 查询 Pubmed 数据库。 esearch端点有一个排序选项，但 API 文档没有列出这个值的所有选项。 http://www.ncbi.
我有 pmids 列表我想在单个网址点击中获取他们两个的摘要 pmids=[17284678,9997] abstract_dict={} url = https://euti
我正在使用JEUtils在 Java 中获取并解析 Pubmed 结果(这是一个似乎已被放弃的工具)。 从几天前开始，该工具在某些结果中抛出异常，经过检查，Pubmed 似乎没有尊重自己的 DTD (
我正在尝试针对 Pubmed 的 Eutils 服务运行一些查询。如果我在网站上运行它们，我会返回一定数量的记录，在本例中为 13126 ( link to pubmed )。 不久前，我将一个 py
我有一些代码可以访问 PubMed 中的文章并解析每个 XML 中的一些信息。该程序在我的计算机上运行良好，但需要很多时间才能完成。因此，当我在 UNIX 机器上运行它(特别是对于此类事情)时，我发出
你能告诉我如何从PubMed 获取5 篇最新文章吗？包含“肥胖”一词并使用 Python 返回每篇论文的作者、标题、日期、doi 和 PubMed PMID？提前谢谢你 编辑: 到目前为止我的尝试。我
我的总体目标是构建一个共同作者网络图。我有一个 PubMed ID 的列表，这些是我唯一感兴趣的关于共同作者网络图表的出版物。我无法弄清楚如何使用 rentrez 在我的查询中同时获取作者姓名和各自的
我一直在使用 R 中非常有用的 rentrez 包从 Pubmed 数据库中获取有关作者、文章 ID 和作者隶属关系的信息。这工作正常，但现在我想从附属字段中提取信息。不幸的是，隶属关系字段是广泛的非
我编写了一个 PHP 脚本，它根据用户输入自动搜索 NCBI Pubmed 数据库。这是一个相当大的脚本，我不会费心把它全部放在这里。但我无法弄清楚的一个问题是，为什么当我使用 esearch(eut
我想下载所有发布的数据摘要。 有谁知道我如何轻松下载所有已发表的文章摘要？ 我得到了数据的来源: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/pmc/af/12/ 反正有没有下载所有
我最近一直在使用优秀的rplos package ，这使得搜索公共(public)科学图书馆 (PLOS) API 上托管的论文变得非常容易。我遇到了一个障碍，因为 API 本身似乎缺少一些信息 -
我正在尝试使用 PubMed API 搜索具有确切标题的文章。举个例子，我想搜索标题 The cost-effectiveness of mirtazapine versus paroxetine i
根据NCBI Help Desk 的回答之一，我们无法“批量下载”医学中心 .但是，我可以使用“NCBI E-utilities”下载吗？全部 PMC 数据库中的全文论文使用 Efetch 或者至少使
有没有人实现了一个程序，可以下载带有标题、作者、日期和内容的已发表摘要，以在给定 MESH 术语的情况下将纯文本文件分开？ 最佳答案 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entre
我正在尝试使用 python 抓取 pubmed 并获取一篇文章被引用的所有论文的 pubmed ID。 例如本文(ID:11825149) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/p
我手动转到 pubmed，例如搜索我的主题，例如 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Cancer+TFF然后从夏天开始，我得到了 PMID。然后尝试使用
我是一名优秀的程序员,十分优秀！