c - 抑制 R 中的 C 警告消息

Question

我正在调用与 libsvm(C 程序)接口(interface)的 R 包 e1071 中的 R 函数。此函数将 C (printf) 警告消息传递到 R 控制台。我知道这一点是因为警告消息的形式是 (warning:...) 而 R 警告消息是大写的 (即 Warning:...)。

我已尽一切努力摆脱 R 中的这些消息(sink、suppressWarnings、invisible)，但似乎没有任何效果。

有什么想法吗？

谢谢!

Answer 1

该函数使用 stdio 而不是 Rprintf/REprintf 或 warning 这就是为什么重定向R 输出将不起作用。正确的解决方案是修复 libsvm 中的调用，改为使用 R 输出。

破解 stdio 输出是可能的 - 您可以将输出重定向到您自己的管道并用它做您想做的事，但是 a) 它在 C 中有点工作 b) 它是危险，因为您需要在完成该函数后恢复标准行为 - 即使它出错，并且 c) 如果在 shell 上使用，可能会与 R 输出交互。

如果你想要一个非常古怪、肮脏但快速的解决方案，请在 collect(parallel(..., silent=TRUE))[[1]] 中运行你的函数，来自 multicore - 它抑制 stdout(如果你也想抑制 stderr，你可以添加 multicore:::closeStderr())。