gephi - 将自定义分区导入 Gephi

Question

我想知道 gephi 是否支持导入一个集群文件，该文件在单独的行上具有图表中每个节点的社区分配(类似于 Pajek .clu 格式)？我正在寻找一种方法来为属于同一社区的节点着色。在 igraph(对于 R)中，我可以导入这个文件并根据它设置顶点颜色属性。想知道 gephi 是否有类似的功能？

我看到了这个答案here 5 多年前说这是不可能的，想知道现在是否改变了？

谢谢!

Answer 1

.clu 文件包含每个节点一行，其中簇号至少是我看到的示例 here . Gephi 无法直接导入它，但您可以欺骗它以获得相同的结果。以下是我建议的步骤:

1. 使用 Gephi 导入您的 .net 文件
2. 转到 Data Laboratory 并根据 Id 列对节点进行排序，方法是点击列名
3. 通过按屏幕底部的添加列 创建一个名为Cluster 的新列。默认的 String 类型就可以了
4. 点击导出表，只选择字段Id和Cluster，然后将文件导出到某处
5. 使用例如打开 CSV 文件Excel 或 LibreOffice
6. 用文本编辑器打开你的.clu文件，记事本也行
7. 复制文件中的所有数字，将它们粘贴到 CSV 的 Cluster 列中。保存您的 CSV
8. 通过点击Import Spreadsheet 将 CSV 导入回 Gephi，然后按确定完成后续步骤。

最后，您应该会看到您的 Cluster 值与 .clu 文件中的值相同!

确保在第 4 步和第 8 步中始终使用相同的字段分隔符。我建议使用 ;，因为 Excel 可以直接理解它。

如果还有问题，欢迎反馈