r - 将堆叠条形图作为注释时只有一个条

Question

我正在尝试制作堆叠条形图作为热图上的列注释。我使用 ComplexHeatmap。

这是条形图的输入 (foo):

      V1    V2    V3
1  28.50 67.30  0.00
2   0.00 63.90 25.40
3  16.30 67.80 15.90
4  24.10 75.30  0.00
5   0.00 70.90 20.60
6  18.90 62.50 13.90
7  19.80 68.70 11.50
8  22.60 64.90 10.10
9  28.10 66.80  0.00
10 16.60 74.30  0.08
11  0.14 79.90  0.06
12 23.70  0.71  0.00
13 26.70 66.60  0.00
14 16.80 58.20 20.60
15 13.30 82.20  0.00
16  0.32 61.70  6.30
17 21.50 62.20  0.14

为了简单起见，我删除了其他注释和热图，只制作了“麻烦”的注释图。这是我的代码:

library(ComplexHeatmap)
ha = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(foo), annotation_height = unit(30,"mm"))
hm = Heatmap(zero_row_mat, top_annotation = ha)
hm

这是生成的条形图

阅读 ComplexHeatmap 引用手册时，我希望得到一个堆叠条形图，因为我的输入是一个矩阵(超过 1 列)，但我只得到一个酒吧。我不知道我做错了什么。有什么想法吗？

Answer 1

你是对的，当我运行时:

DF <- data.frame( A = rep(c(0,5), 5), B = 2:11, C = 3:12 )
hb = HeatmapAnnotation(barplot = anno_barplot(DF), annotation_height = unit(30,"mm"))
hm = Heatmap(matrix(1:10,nrow=1), top_annotation = hb)
hm

我得到了一个堆叠条形图。你得到了什么？