R:邻接表到邻接矩阵

Question

Bonjour，我想将邻接列表(3 列)转换为邻接矩阵。在这个论坛中，我找到了多个有关如何将边列表转换为邻接矩阵的示例。我成功地为两列列表做到了这一点。我已经尝试了在网上可以找到的所有解决方案，但似乎我错过了一个小步骤。

我尝试了什么

我的变量是用户、国家/地区、书籍

User<-c("maman","sophia","Antoine")  
Country<-c("Canada","USA","Mexico")  
books<-c("Coelho","Rimbaud","The flight") 
dat<-data.frame(User, Country,books)  


User |       Country | books   
maman |        Canada  |    Coelho   
sophia|          USA  |    Rimbaud  
Antoine|     Mexico  | The flight

第一次尝试

library(igraph)     
m<-as.matrix(dat)    
g<-graph.adjacency(m, mode="directed") ### If that worked I could have used      
"get.adjacency" 

第二次尝试

尝试将数据转换为边缘列表，但由于存在三列而出现错误

el<-as.matrix(dat)       
g=graph.edgelist(el,directed=TRUE) # turns   

异常输出

     maman sophia Antoine Canada USA Mexico Coelho Rimbaud The fligth
maman    1   0     1       0      0   0      0        1          0
sophia   0   0     0       0      1   0      1        0          1
Antoine  0   1     1       0      1   0      0        1          0
Canada   1   0     1       0      0   1      0        1          1
 USA     0   0     0       1      0   0      0        0          1
 Mexico  0   0     0       0      1   1      1        0          0 
Coelho   0   0     1       1      0    1      0       1          0
Rimbaud  1   0     1       1      0    0      0       1          1
The fligth 0 1     0       0      1    1      0       0          1

我想查看所有顶点之间的相互作用。与此类似的东西:http://sna.stanford.edu/sna_R_labs/output/lab_1/1.3_Krackhardt_Friendship.pdf

任何帮助或指示将不胜感激!

Answer 1

也许这就是您所追求的:

m <- as.matrix(dat)
el <- cbind(m[, 1], c(m[, -1]))

这里，el 是一个边列表，通过将 m 的第一列与通过删除矩阵子集的维度而得到的向量绑定(bind)而创建 >m[, 2:3] (相当于 m[, -1])。请注意，cbind 中的第一个向量有 3 个元素，而第二个向量有 6 个元素。第一个将被回收到第二个的长度。我们所做的相当于 cbind(rep(m[, 1], 2), m[, -1])。

这是我们的边缘列表的样子。

el
##      [,1]      [,2]        
## [1,] "maman"   "Canada"    
## [2,] "sophia"  "USA"       
## [3,] "Antoine" "Mexico"    
## [4,] "maman"   "Coelho"    
## [5,] "sophia"  "Rimbaud"   
## [6,] "Antoine" "The flight"

现在，我们可以通过使用 graph.edgelist 绘制边列表并使用 get.adjacency 提取邻接矩阵来获取邻接矩阵。

get.adjacency(graph.edgelist(el))

## 9 x 9 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
##            maman Canada sophia USA Antoine Mexico Coelho Rimbaud The flight
## maman          .      1      .   .       .      .      1       .          .
## Canada         .      .      .   .       .      .      .       .          .
## sophia         .      .      .   1       .      .      .       1          .
## USA            .      .      .   .       .      .      .       .          .
## Antoine        .      .      .   .       .      1      .       .          1
## Mexico         .      .      .   .       .      .      .       .          .
## Coelho         .      .      .   .       .      .      .       .          .
## Rimbaud        .      .      .   .       .      .      .       .          .
## The flight     .      .      .   .       .      .      .       .          .