SLURM sacct 显示 'batch' 和 'extern' 作业名称

Question

我已将作业提交到 SLURM 队列，该作业已运行并完成。然后我使用 sacct 检查已完成的作业命令。但是在查看 sacct 命令的结果时，我注意到了我没想到的其他结果:

       JobID                        JobName      State      NCPUS  Timelimit
5297048                                test  COMPLETED          1   00:10:00  
5297048.bat+                          batch  COMPLETED          1           
5297048.ext+                         extern  COMPLETED          1       

谁能解释一下“批处理”和“外部”工作是什么以及它们的目的是什么。为什么即使主要工作失败，外部工作也总是完成。

我试图搜索文档，但没有找到令人满意和完整的答案。

编辑:这是我提交的脚本以生成上述 sacct输出:

#!/bin/bash
echo test_script > done.txt

与以下 sbatch命令:

sbatch -A BRIDGE-CORE-SL2-CPU --nodes=1 --ntasks=1 -p skylake --cpus-per-task 1 -J jobname -t 00:10:00 --output=./output.out --error=./error.err < test.sh

Answer 1

一个 Slurm 作业包含多个作业步骤，这些步骤都由 Slurm 单独计算(在资源使用方面)。通常，这些步骤是使用 srun/mpirun 创建并从 0 开始枚举的。但除此之外，有时还有两个特殊步骤。例如，采取以下工作:sbatch -n 4 --wrap="srun hostname; srun echo Hello World"这导致了以下 sacct 输出:

       JobID    JobName  Partition    Account  AllocCPUS      State ExitCode 
------------ ---------- ---------- ---------- ---------- ---------- -------- 
5163571            wrap     medium      admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.bat+      batch                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.ext+     extern                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.0      hostname                 admin          4  COMPLETED      0:0 
5163571.1          echo                 admin          4  COMPLETED      0:0 

两人 srun调用创建了步骤 5163571.0和 5163571.1 . 5163571.bat+考虑批处理脚本所需的资源(在这种情况下只是 srun hostname; srun echo Hello World 。 --wrap 只是将其放入文件并添加 #!/bin/sh )。
许多非 MPI 程序在批处理步骤中进行了大量计算，因此资源使用情况在那里计算。
现在为 5163571.ext+ :此步骤考虑了该作业在 slurm 之外的所有资源使用情况。这仅显示，如果 PrologFlag contain用来。
属于 slurm 作业但不受 slurm 直接控制的进程的一个示例是 ssh session 。如果您通过 ssh 进入运行其中一个作业的节点，您的 session 将被置于作业的上下文中(并且您将被 cgroups 限制为可用资源，如果已设置)。您在该 ssh session 中进行的所有计算都将在 .extern 作业步骤中进行计算。