r - 无法永久更改 R (OS X) 中的 CRAN 存储库

Question

我正在焦急地想弄清楚为什么我无法永久更改在我的 OS X 10.11.3 系统上的 R 中使用的 CRAN 存储库。我已经按照网上的说明进行操作，例如 this SO question和 this SO question和 this webpage ，并将其放入我的 .Rprofile 文件中:

# Change the default repository
local({r <- getOption("repos")
       r["CRAN"] <- "https://cran.cnr.berkeley.edu/" 
       options(repos=r)
})
print(getOption("repos"))

这个片段几乎直接来自 R 自己的 example("Startup") 东西，看起来它确实应该工作。我把它作为我的 .Rprofile 中的第一件事，而我的 .Rprofile 的其余部分是微不足道的，不会触及这个选项。如果我退出重新启动 R.app，我会在启动的适当位置看到我的 print 语句的输出:

                            CRAN 
"https://cran.cnr.berkeley.edu/" 

看起来不错，对吧？不幸的是，如果我随后输入 getOption("repos")，我会得到这个:

                              CRAN 
"http://cran.parentingamerica.com" 

不幸的是，parentingamerica.com 镜像似乎已经死了，至少今天是这样。有人在我的 .Rprofile 之后设置选项，但我不知道是谁。我没有~/.RData文件；启动时没有加载任何工作区。我没有 .Rprofile.site 文件，R 安装中的 Renviron 文件是默认文件，没有提及“parentingamerica.com”，也没有设置“repos” 选项。事实上，我已经在我的整个 R.framework 目录中对任何包含“parentingamerica”的文件进行了 find/grep，但空手而归。我的 R_HOME/etc/ 目录中只有 Makecof、Renviron、javaconf、ldpaths 和存储库。我不确定该存储库文件的确切用途，但它不包含“parentingamerica”。

我整个上午都在为这个问题折腾。知道这个 %^$@* parentingamerica.com 选项是从哪里来的以及我如何才能杀死它？？

Answer 1

我将启动面板状态的图像粘贴到您的答案中。然后我在文本上退格并关闭首选项对话框，退出 R，并编辑我的 .Rprofile 文件以包含此行:

options(repos="https://cloud.r-project.org/")

然后我打开了一个 R.app session 并看到了这个结果:

> getOption('repos')
[1] "https://https://cloud.r-project.org/"

首选项/启动面板显示默认 CRAN 镜像设置以保持空白。所以在我看来，首选项设置的行为确实允许您使用 .Rprofile 来选择您的默认存储库(如果这是您选择的策略)。 (我还检查了这个 repo 设置是否被 Package Installer 接受了。)