r - 计算一列与选择的其他列之间的相关性，无需循环

Question

w= as.numeric()
for(i in 2:10)){
    w[i] = cor(a[,1], a[,i], method = "pearson", use = "complete.obs")
 }

是否有办法将以下 for 循环转换为一行代码，如下所示？

w[1:9] = cor(a[,1], a[,i], method = "pearson", use = "complete.obs")

Answer 1

关于:

w = sapply(c(2:10), function(x) cor(a[,1], a[,x], method = "pearson", use = 'pairwise.complete.obs') )

假设您使用 2:10 的原因是因为有 10 列。如果是这种情况并且您希望它更加动态:

w = sapply(c(2:ncol(a)), function(x) cor(a[,1], a[,x], method = "pearson", use = "complete.obs") )

最后，如果您不想使用 apply 系列，您可以生成整个 cor 矩阵并从第一行中提取您需要的内容:

w = cor(a, method = 'pearson', use = 'pairwise.complete.obs')[1,-1]

可重现的示例:

> a = iris[,1:4]
> cor(a, method = 'pearson', use = 'pairwise.complete.obs')[1,-1]
 Sepal.Width Petal.Length  Petal.Width 
 -0.1175698    0.8717538    0.8179411 

编辑:如果您想检索不同列的相关性(例如 2):

> cor(a, method = 'pearson', use = 'pairwise.complete.obs')[2,-2]
Sepal.Length Petal.Length  Petal.Width 
-0.1175698   -0.4284401   -0.3661259 

此外，根据 Joris Meys 的建议，请确保使用 'pairwise.complete.obs'