pickle - mpi4py 尝试发送类时出现 Pickling 错误

Question

我使用 mpi4py 将一些计算拆分到多个过程中。基本上我只是计算一些凸包的体积，这是我使用 tvtk 和 mayavi 创建的。

只有第一个过程导入这些库:

...
if rank==0:
   from tvtk.api import tvtk
   from mayavi Import mlab
   ...
   mlab.figure(size=(1024,768),bgcolor=(1,1,1))
   ...

然后，我尝试在所有进程之间共享对象 mlab 和 tvtk:

for i in range(comm.Get_size()):
    comm.send(mlab,dest=i)
    comm.send(tvtk,dest=i)
....

以下步骤看起来像......

Points=local_data
ug=tvtk.UnstructuredGrid(Points=Points)
...
dataname="Data %s " % rank
ds=mlab.pipeline.add_dataset(ug,name=dataname)
delaunay=mlab.pipeline.delaunay3d(ds,name=dataname)
... calc volume...

但是，显然不可能发送实例/类(或任何 mlab 和 tvtk )，因为我总是收到以下错误:

comm.send(mlab,dest=i)
File "Comm.pyx", line 753, in mpi4py.MPI.Comm.send (src/mpi4py.MPI.c:53848)
File "pickled.pxi", line 122, in mpi4py.MPI.PyMPI_send (src/mpi4py.MPI.c:20409)
 File "pickled.pxi", line 39, in mpi4py.MPI._p_Pickle.dump (src/mpi4py.MPI.c:19503)
cPickle.PicklingError: Can't pickle <type 'module'>: attribute lookup __builtin__.module failed

有没有办法在所有进程之间“共享”实例 mlab 和 tvtk？

编辑:简短的例子；你能让这个工作吗？

from mpi4py import MPI
comm=MPI.COMM_WORLD

size=comm.Get_size()
rank=comm.Get_rank()

if rank==0:
        from tvtk.api import tvtk
        from mayavi import mlab

if __name__=='__main__':
        if rank==0:
                for i in range(size):
                        comm.send(mlab,dest=i)
                        comm.send(tvtk,dest=i)
        else:
                local_mlab=comm.recv(mlab,source=0)
                local_tvtk=comm.recv(tvtk,source=0)

Answer 1

我想以下内容可能适合您的情况

from mpi4py import MPI
MPI._p_pickle.dumps = dill.dumps
MPI._p_pickle.loads = dill.loads