knitr - latex knitr chunk echo=FALSE 破坏了 par() 设置

Question

我是 latex 和 knitr 的新手，当我使用 echo=FALSE 时，R block 的输出有问题。下面的 .Rnw 代码按预期工作，即输出有

    1. some code
    2. a block of figures arranged 2 x 3
    3. some more code
    4. a block of figures arranged 2 x 3

然而改变 block 开口以从输出中消除代码块

<<bghist2_mas_rma, fig.height=4, fig.width=6, echo=FALSE>>=

不仅从输出中删除了代码(好)，而且还覆盖了 par() 设置，使得两个数字(每个 2 x 3)在页面上相邻放置，第二个的大部分从边缘。

除了简单地将代码留在输出中之外，我还能如何解决这个问题？

谢谢

B

\newpage
<<bghist2_mas_rma, fig.height=4, fig.width=6, echo=TRUE>>=
par(mfrow=c(2,3))
for(i in 1:6){
    hist(bg.mas[,i], xlab="", las=1,
    main=paste(sep="", "bg.mas[, ",  i, "]"),
    xlim=c(-100, 300), breaks=10000)
}
par(mfrow=c(1,1))

par(mfrow=c(2,3))
for(i in 1:6){
    hist(bg.rma[,i], xlab="", las=1,
    main=paste(sep="", "bg.rma[, ",  i, "]"),
    xlim=c(-100, 300), breaks=10000)
}
par(mfrow=c(1,1))
@

Answer 1

最简单的解决方案是将它们拆分成单独的 block :

<<bghist2_mas_rma, fig.height=4, fig.width=6, echo=FALSE>>=
par(mfrow=c(2,3))
for(i in 1:6){
    hist(bg.mas[,i], xlab="", las=1,
    main=paste(sep="", "bg.mas[, ",  i, "]"),
    xlim=c(-100, 300), breaks=10000)
}
@

<<bghist2_mas_rma_2, fig.height=4, fig.width=6, echo=FALSE>>=
par(mfrow=c(2,3))
for(i in 1:6){
    hist(bg.rma[,i], xlab="", las=1,
    main=paste(sep="", "bg.rma[, ",  i, "]"),
    xlim=c(-100, 300), breaks=10000)
}
par(mfrow=c(1,1))
@