r - 使用 dplyr() 检索通过 group_by() 和 do() 创建的模型对象

Question

我正在尝试使用dplyr和管道运算符(%>%)来检索存储在数据框中的模型对象。

带有示例数据

library(dplyr)

set.seed(256)
dat <- 
  data.frame(x = rnorm(100), 
           y = rnorm(100, 10), 
           spec = sample(c("1", "2"), 100, TRUE)) %>%
  group_by(spec) %>%
  do(lm = lm(y ~ x, data = .))

我可以子集并检索实际的模型对象

> dat$lm[dat$spec == "1"][[1]]

Call:
lm(formula = y ~ x, data = .)

Coefficients:
(Intercept)            x  
     9.8171      -0.2292  

> dat$lm[dat$spec == "1"][[1]] %>% class()
[1] "lm

但我认为这是检索其中包含的 lm() 模型对象的一种不优雅的方式，特别是考虑到我的代码的其余部分采用“dplyr”方式构建”。我想使用 dplyr，但我不知道如何使用。例如，使用

dat %>% filter(spec == "1") %>% select(lm) 

返回时不起作用

Source: local data frame [1 x 1]
Groups: <by row>

# A tibble: 1 x 1
  lm      
  <list>  
1 <S3: lm>

和

dat %>% filter(spec == "1") %>% .$lm

仅让我到达列表中的第一个对象，例如

> dat %>% filter(spec == "1") %>% .$lm
[[1]]

Call:
lm(formula = y ~ x, data = .)

Coefficients:
(Intercept)            x  
   10.01495     -0.07438  

我无法找到使用 dplyr 获取 dat 中实际模型对象的方法。当然，我可以使用 broom 和 tidy() 来压缩所有内容

library(broom)
tidy(dat, lm)

但这仍然不会返回实际的模型对象:

> tidy(dat, lm)
# A tibble: 4 x 6
# Groups: spec [2]
  spec  term        estimate std.error statistic                        p.value
  <fct> <chr>          <dbl>     <dbl>     <dbl>                          <dbl>
1 1     (Intercept)  10.0        0.120    83.3                         1.91e-54
2 1     x           - 0.0744     0.111   - 0.671                       5.05e- 1
3 2     (Intercept)   9.86       0.131    75.0                         1.42e-50
4 2     x           - 0.0793     0.148   - 0.535                       5.95e- 1

我什至可以使用dplyr来summarise()来自do()调用的输出并从模型中检索系数，但是这仍然没有给我模型对象本身:

dat %>% 
  select(spec) %>%
  bind_cols(dat %>%
              summarize(lm_i = coefficients(lm)[[1]], 
                        lm_s = coefficients(lm)[[2]]))

是否有一种 dplyr 方法可以从使用 do() 创建的模型中检索实际模型对象？

Answer 1

do 返回一个列表列，因此要提取其各个元素，您需要使用列表子集。有多种方法可以做到这一点，但在 tidyverse 中，purrr::pluck 是提取单个[可能深度嵌套]元素的不错选择:

library(tidyverse)

dat %>% pluck('lm', 1)
#> 
#> Call:
#> lm(formula = y ~ x, data = .)
#> 
#> Coefficients:
#> (Intercept)            x  
#>    10.01495     -0.07438

它主要相当于[[子集，即

dat[['lm']][[1]]

要获得所需的工作，您需要继续子集化，因为 .$lm 返回列表列，在本例中是模型列表。 .[[1]](类似于上面的1)从列表中提取模型:

dat %>% filter(spec == "1") %>% .$lm %>% .[[1]]

或者混合方法，如果你愿意的话:

dat %>% filter(spec == "1") %>% pluck('lm', 1)

或使用pull提取具有NSE语义的列:

dat %>% filter(spec == "1") %>% pull(lm) %>% pluck(1)

所有返回的内容都是相同的。